- Patogénesis y respuesta inmunitaria de las infecciones por virus entéricos: rotavirus y norovirus. Se estudian los mecanismos patogénicos y la respuesta inmunitaria de las infecciones por los dos principales virus entéricos (rotavirus y norovirus).

- Epidemiología molecular de infecciones por rotavirus y norovirus. Se analiza la epidemiología de rotavirus y norovirus mediante la aplicación de técnicas moleculares (RT-PCR, qPCR, secuenciación de cDNA, etc.) y en la detección de nuevas variantes de genotipos víricos y de virus recombinantes.

- Estudio de las interacciones virus/microbiota/hospedador. El objetivo de la presente línea de investigación es descifrar las interacciones que ocurren entre los virus entéricos y el hospedador, sin excluir las interacciones que se producen entre los virus y la microbiota intestinal ni la interacción entre la microbiota intestinal y el hospedador.