- Patogènesi i resposta immunitària de les infeccions per virus entèrics: rotavirus i norovirus. S'estudien els mecanismes patogènics i la resposta immunitària de les infeccions pels dos principals virus entèrics (rotavirus i norovirus).

- Epidemiologia molecular d'infeccions per rotavirus i norovirus. S'analitza l'epidemiologia de rotavirus i norovirus mitjançant l'aplicació de tècniques moleculars (RT-PCR, qPCR, seqüenciació de cDNA, etc.) i en la detecció de noves variants de genotips vírics i de virus recombinants.

- Estudi de les interaccions virus / microbiota / hoste. L'objectiu de la present línia d'investigació és desxifrar les interaccions que ocorren entre els virus entèrics i l'hoste, sense excloure les interaccions que es produeixen entre els virus i la microbiota intestinal ni la interacció entre la microbiota intestinal i l'hoste.