La missió de l'Institut Cavanilles de Biodiversitat i Biologia Evolutiva és desenvolupar, aplicar i formar en el coneixement científic en el camp de la diversitat i l'evolució biològiques mitjançant les següents accions:
- Recerca fonamental.
- Recerca aplicada.
- Formació d'investigadors i especialista.
- Difusió social del coneixement.
- Assistència tècnic-científica a entitats públiques i privades.
- Consell científic.
En el desenvolupament de la seua missió l'Institut fa èmfasi en la integració teòrica i metodològica pluridisciplinar.
