El Máster de Paleontología Aplicada es un máster interuniversitario que se desarrolla de forma presencial entre los Departamentos de Botánica y Geología de la Universidad de Valencia (UVEG) y Ciencias de la Tierra y del Medio Ambiente de la Universidad de Alicante (UA), poniendo una amplia gama de espacios de trabajo para su formación.
Para ello en ambos departamentos, se han designado aulas específicas para la enseñanza y, especialmente, para la investigación de los estudiantes. En particular, en el Departamento de Botánica y Geología la mayor parte de la docencia se desarrolla entre el Seminario de Geología y el Laboratorio 2 de Paleontología, ambos ubicados en el propio Departamento. En lo que concierne a los recursos dedicados para el Máster Paleontología por el Departamento de Ciencias de la Tierra de la Universidad de Alicante, en el edificio de Ciencias VI, conocido como CTQ, se encuentra el Laboratorio 3 y la Sala de microscopía, las cuales copan la mayor parte de las clases, tanto teóricas, como prácticas, así como seminarios docentes y tutorías grupales.