El Màster de Paleontologia Aplicada és un màster interuniversitari que es desenvolupa de manera presencial entre els Departaments de Botànica i Geologia de la Universitat de València (UVEG) i Ciències de la Terra i del Medi Ambient de la Universitat d'Alacant (UA), posant una àmplia gamma d'espais de treball per a la seua formació.
Per a això en tots dos departaments, s'han designat aules específiques per a l'ensenyament i, especialment, per a la investigació dels estudiants. En particular, en el Departament de Botànica i Geologia la major part de la docència es desenvolupa entre el Seminari de Geologia i el Laboratori 2 de Paleontologia, tots dos situats en el propi Departament. En el que concernix als recursos dedicats per al Màster Paleontologia pel Departament de Ciències de la Terra de la Universitat d'Alacant, en l'edifici de Ciències VI, conegut com CTQ, es troba el Laboratori 3 i la Sala de microscòpia, les quals copen la major part de les classes, tant teòriques, com a pràctiques, així com seminaris docents i tutories grupals.