L’Institut d’Investigació Sanitària INCLIVA, de l’Hospital Clínic de València, ha obtingut finançament de l’Institut de Salut Carles III (ISCIII) per al projecte ‘Detecció i caracterització ràpida de COVID-19 i del pacient’. L’investigador principal és Felipe Javier Chaves, director de la Unitat de Genòmica i Diabetis d’INCLIVA; i en el projecte col·labora el Servei de Microbiologia i Parasitologia de l’Hospital Clínic de València, dirigit per David Navarro, catedràtic del Departament de Microbiologia i Ecologia de la Universitat de València.
El projecte ha sigut presentat en el marc de la convocatòria de sol·licitud urgent d’expressions d’interès per al finançament extraordinari de projectes d’investigació sobre SARS-COV-2 i la malaltia COVID-19, dirigida a impulsar propostes “que permeten una implementació i posada en marxa immediata en el Sistema Nacional de Salut, amb resultats concrets, primerencs i aplicables a la situació actual” d’urgència generada per l’impacte d’aquesta pandèmia.
L’estudi se centra a detectar la infecció de manera ràpida i a obtindre informació sobre la seqüència del virus per a determinar-ne la virulència. A més, analitzarà els factors genètics del pacient que modulen l’efecte de la infecció. Amb aquestes dades es podrà determinar el risc de cada pacient i l’evolució de la malaltia.
Per a això, es desenvoluparen kits modulars de baix cost i que puguen treballar a partir de mostres de diferent origen. El procediment serà senzill i de mínima manipulació tant per al processament de la mostra com per a l’anàlisi de resultats. Els kits permetran determinar la presència del virus en entre 15 i 30 minuts i els aspectes genètics del virus i del pacient en 3 o 4 hores.
Els kits es basaran en amplificació isoterma i mitjançant PCR ràpida de les regions d’interès i la seua detecció ràpida. En un segon mòdul, a partir d’aquests amplificats i aquells d’interès en relació al pacient, es generaran llibreries per a ser seqüenciades mitjançant sistemes NGS (Seqüenciació de nova generació de tercera generació) de Nanopore. D’aquesta manera, a través d’un informe sobre la base de les dades disponibles i incloent altres variables clíniques d’interès, es podrà conèixer el cep del virus i les variables del pacient que són rellevants en la malaltia.
L’impacte serà molt elevat en disposar en 1 o 2 mesos de tests que permetran detectar la presència del virus en xicotetes quantitats (entre 1 i 10 còpies del virus en la mostra). També trobarà si hi ha infecció en les persones exposades, la capacitat infectiva i com podria cursar la infecció sobre la base del cep a la qual s’haja exposat i a les seues característiques genètiques. Això permetrà ràpidament pacients infectats i a aquells que poden desenvolupar la malaltia amb més complicacions. El projecte es desenvoluparà en dotze mesos i el finançament de l’ISCIII és de 175.000 €.
Imatges: