Grup d'Investigació en Regulació Transcripcional del Metabolisme Secundari de Plantes

Descripció

Les plantes fabriquen metabòlits especialitzats que ajuden en la interacció i supervivència amb el seu entorn. Aquests compostos, denominats "metabòlits secundaris", constitueixen una rica font de beneficis per a la salut en la nutrició humana, i també representen els components bàsics en el desenvolupament de nous productes farmacèutics. No obstant això, el metabolisme secundari es limita en ocurrència, i alguns compostos estan restringits temporal i espacialment a uns certs grups taxonòmics.

El desenvolupament i el metabolisme secundari són processos estretament connectats. Part d'aquesta associació depén de l'expressió diferencial de gens: si bé la informació s'instrueix i es cableja en el genoma, la seua regulació i visualització en uns certs tipus de cèl·lules determinaran en última instància la capacitat d'acumular diferents metabòlits.

El control del metabolisme secundari en resposta als senyals ambientals i de desenvolupament és exercit per factors de transcripció i correguladors transcripcionals que actuen sobre seqüències d'ADN reguladores cis que determinen quan, on i com s'expressen els gens, però també sobre altres tipus de proteïnes reguladores i ARN. En TOMSlab estem interessats en la regulació transcripcional del metabolisme secundari. Això ha inclòs anàlisis genòmiques de famílies de factors de transcripció i anàlisi d'expressió gènica global, així com un interés en els enfocaments de biologia de sistemes que integren conjunts de dades de transcriptòmica i metabolòmica.

L'enfocament actual del laboratori és l'estudi a nivell mundial de xarxes reguladores de gens que controlen el metabolisme de fenilpropanoids i isoprens en fruits carnosos climatèrics i no climatèrics, com la tomaca (Solanum lycopersicum) i la vinya (Vitis vinifera), respectivament. També estem interessats en diverses altres espècies que posseeixen propietats farmacèutiques potencials que les fan importants per al descobriment de fàrmacs i la millora dels aliments funcionals.

Objectius CT

Generació de dades òmics en espècies vegetals i cultius cel·lulars induïts per a la producció de metabòlits secundaris.
Desenvolupament d'algorismes computacionals per a la integració de dades multi-òmics.
Cultiu in vitro d'espècies comercials de fruiteres o interés medicinal i desenvolupament de plataformes de transformació genètica.
Caracterització funcional de gens reguladors del metabolsime especialitzat de plantes.

Línies d'investigació

Caracterització a tot el genoma de la família de factors de transcripció R2R3-MYB en plantes
Intentem caracteritzar a la família MYB en diferents espècies de plantes combinant estudis de tot el genoma i en caracteritzacions funcionals de planta.
Enfocaments omics integradors per identificar reguladors nous i passos enzimàtics desconeguts de les vies metabòliques secundàries
Associem dades transcriptòmics i metabòlics en òrgans de plantes o cultius cel·lulars per a aïllar enzims metabòlics secundaris desconegudes i els seus reguladors transcripcionals.
Anàlisis del genoma de les respostes de vinya a estrès ambiental, incloses les influenciades pel canvi climàtic
Estem interessats a abordar diferents dades bioinformàtiques acoblats a dades experimentals per a modelar les respostes a l'estrés de les plantes, utilitzant la vinya com a model de fruits carnosos no climatèrics.

Direcció