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La CECT ofrece un servicio de identificación de aislados de procariotas (bacterias y arqueas) basado fundamentalmente en la secuenciación parcial del gen 16S rRNA, junto con una caracterización morfológica y fenotípica básica. También es posible solicitar la secuencia completa del gen 16S rRNA, así como la realización de un estudio filogenético detallado mediante el estudio de dicha secuencia.

Los servicios de identificación disponibles para procariotas son:

 
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