La CECT ofrece tres tipos de depósito: público, restringido y con fines de patente según el Tratado de Budapest.
La CECT acepta solicitudes de depósito de cepas de arqueas, bacterias, hongos filamentosos, hongos micorrícicos y levaduras hasta grupo de riesgo 3 (**) de acuerdo a la definición del Real Decreto 664/1997 del 12 de Mayo de 1997 y sus posteriores enmiendas, que transpone la directiva europea 2000/54/EC. Antes de realizar cualquier tipo de depósito de cepas en la CECT, rogamos consulten el procedimiento detallado en los siguientes enlaces: