El programa de Doctorado en Contabilidad y Finanzas Corporativas actual tiene sus orígenes en 2003, cuando el programa obtuvo la Mención de Calidad otorgada por el Ministerio de Educación, reconocimiento que fue pionero en toda España. En 2013 la ANECA verificó positivamente el programa de Doctorado después de su adaptación al RD 99/2011, y es este programa el que está vigente en la actualidad. Las líneas de investigación anteriormente existentes se han reorganizado en tres grupos: (A) Mercados de Capital y Finanzas Corporativas, (B) Información financiera en los sectores público y privado, y (C ) Auditoría, Control de Gestión y Gobierno Corporativo.

En el curso pasado 2016/17, fue elegido como uno de los dos programas piloto para ser evaluado por la AVAP, habiendo recibido en febrero de 2018 una valoración favorable por dicha agencia de evaluación externa.