El Doctorado está organizado por la Facultad de Física. Su periodo de formación se estructura en torno al Máster Universitario en Física Avanzada de la Universidad de Valencia. Su periodo de investigación tiene un pequeño complemento docente denominado "Seminarios Especializados" en el que se ofertarán programas docentes especializados en una o varias temáticas.

En este complemento docente del Programa de Doctorado en Física participarán esencialmente doctores de los Departamentos de Astronomía y Astrofísica; Física Aplicada y Electromagnetismo; Física Atómica, Molecular y Nuclear; Física Teórica; y Óptica; todos ellos de la Universidad de Valencia; doctores del Instituto de Física Corpuscular (centro mixto Universidad de Valencia-CSIC); y doctores de la Fundación General de la Universidad de Valencia que estén adscritos como investigadores a los departamentos o instituto previamente indicados.

Desde el punto de vista académico y científico, el interés y relevancia del Programa de Doctorado de Física está directamente relacionado con la capacitación que proporciona para la docencia e investigación en los sectores públicos y privados. Adicionalmente, desde el punto de vista profesional, la transcendencia de la contribución de la Física al desarrollo tecnológico, y por tanto a la formación de tecnólogos, es crucial en cualquier sociedad moderna que quiera basar su desarrollo en el conocimiento puntero.