El grupo de Ecología Evolutiva realiza estudios empíricos y teóricos en ecología de poblaciones y evolutiva en los que utiliza a los rotíferos como organismos modelo. Los intereses científicos específicos del grupo incluyen:

1. Estudio de la adaptación a la variación ambiental en el tiempo y en el espacio (componentes genéticos, fisiológicos y etológicos).
2. Identificación y caracterización ecológica de especies crípticas de rotíferos.
3. Investigación de las implicaciones demográficas, genéticas y evolutivas de la partenogénesis cíclica.
4. Evolución de los ciclos vitales en los rotíferos, con especial atención en la evolución de los patrones de reproducción sexual (inducción, optimización y comportamiento de apareamiento).
5. Análisis de viabilidad y de dinámicas complejas de poblaciones.
6. Procesos mediadores de la coexistencia de especies competidoras.
7. Implicaciones ecológicas y evolutivas de los bancos de huevos diapáusicos; y (8) estudios de ecología genética (diferenciación poblacional, variación intrapoblacional y adaptación local).