Aquest curs està concebut per a professionals que requerisquen en el seu treball de l'anàlisi d'imatges digitals per a l'obtenció de dades quantitatives. Encara que els continguts i habilitats que es treballen tenen una clara aplicació en els camps de la Microscòpia i la Biologia Cel·lular, es tracta d'eines perfectament traslladables a l'anàlisi d'imatges en altres àmbits dins i fora de les Biociències. L'objectiu principal del curs és aconseguir que les/us participants comprenguen la naturalesa de les imatges digitals i siguen capaces de manipular-les dissenyant fluxos d'anàlisis completes per a extraure dades quantitatives no esbiaixades. El programa intercalada sessions “teòriques” de conceptes i exemples amb hores de “pràctiques” consistents en exercicis guiats pel professorat en la pròpia sessió i treball individual asíncron. No es requereixen coneixements previs d'anàlisi digital o programació.

OBJECTIUS FORMATIUS

• Comprendre la naturalesa i propietats de les imatges digitals.
• Reconéixer i descriure la importància de les diferents etapes d'un diagrama de flux de treball d'anàlisi d'imatge.
• Conéixer i aplicar diferents tècniques de realç i restauració d'imatges, incloent-hi la manipulació de l'histograma, l'aplicació de filtres matricials i les operacions aritmètiques entre imatges.
• Distingir entre els diferents tipus de segmentació i ser capaç d'aplicar diverses tècniques incloent tant bàsiques (*Thresholding) com avançades (basades en *machine *learning) per a la classificació de píxels i la identificació automàtica d'objectes d'interés.
• Comprendre la naturalesa i propietats de les imatges binàries, així com les operacions que poden realitzar-se sobre elles.
• Identificar els diferents paràmetres morfomètrics i densitomètrics que es poden extraure de les imatges digitals i comprendre la seua aplicació en l'anàlisi quantitativa.
• Entrenar a les/us estudiants en l'ús de programes d'anàlisis d'imatge de lliure distribució.

• Unitat 1: Propietats de la imatge digital i diagrames de flux d'anàlisi.
• Unitat 2: Operacions de realç i restauració d'imatges digitals.
• Unitat 3: Tècniques de segmentació: classificació de píxels i identificació d'objectes d'interés.
• Unitat 4: Operacions amb imatges binàries.
• Unitat 5: Obtenció de mesures quantitatives: paràmetres i la seua aplicació.

En finalitzar l'acció formativa l'alumnat podrà:

• Comprendre l'essència del procés de digitalització d'imatges i les implicacions que té a l'hora de manipular-les i extraure dades quantitatives d'elles.
• Reconéixer en una imatge les seues dimensions i ser capaç d'interpretar les seues metadades.
• Dissenyar fluxos de treball complets d'anàlisi d'imatge per a l'obtenció de dades quantitatives.
• Aplicar operacions de realç i restauració d'imatges destinades a corregir defectes en el procés de captura i/o a afavorir la posterior identificació d'objectes.
• Segmentar imatges digitals utilitzant tècniques amb diferent nivell de complexitat per a aconseguir la identificació automàtica d'objectes/regions d'interés.
• Manipular de manera eficient imatges binàries.
• Extraure tot tipus de paràmetres quantitatius dels objectes d'interés identificats en forma de taula de resultats i comprendre la seua naturalesa i aplicacions.
   

L'aprofitament d'aquest curs requereix de l'alumnat:

• Assistència al 85% de les sessions en línia
• Lliurament de totes les tasques asíncrones sol·licitades dins del termini estipulat