El grupo está formado por varios investigadores de los departamentos de Informática y Estadística e Inv. Operativa con una larga trayectoria de trabajo en común, junto con la incorporación de otras personas llegadas posteriormente al dpto. de informática y varias colaboradoras, también ligadas por investigación común previa, de la Universitat Jaume I de Castellón. El nexo común más general es la visión por computador y análisis de imagen, tanto 2D como recientemente 3D, con especial atención a la imagen médica y a la generada por procesos biológicos. El objetivo común es aportar experiencia, currículum y soluciones aplicables a problemas médicos o industriales relacionados con el análisis de imagen, análisis de formas, reconstrucción y modelización de estructuras anatómicas y recuperación de información en bases de datos de imágenes. Debido a la complejidad del software que se debe desarrollar es necesaria una visión formal que atienda a la modelización del software y la interacción de éste con el usuario. En concreto, la actividad investigadora desarrollada hasta ahora, y que a la que se pretende dar si cabe mayor cohesión, se organiza en las siguientes líneas:

• Segmentación y corregistro de estructuras anatómicas, en particular a partir de imágenes de radiología, imágenes de resonancia magnética, imágenes de tomografía de emisión de positrones (PET) u otras modalidades, si el caso lo requiere. El análisis estadístico de las formas obtenidas para su comparación, indexado o modelización requiere el uso de técnicas de morfometría que conectan esta línea con la siguiente.
• Morfometría, entendida como análisis estadístico de formas, tanto 2D como 3D, para determinar sus variaciones temporales o entre grupos de casos y la obtención de prototipos representativos de clases de formas.
• Fisiología Computacional, entendida como la modelización multi-escala de procesos biológicos y médicos por medio de herramientas ICT para entender mejor la pato-fisiología y mejorar el diagnóstico y tratamiento de las enfermedades. La modelización a mayor escala (órganos) conecta esta línea con la anterior, en tanto que el análisis de formas se aplique a órganos como el hígado o el corazón; la modelización a menor escala lo conecta con la línea siguiente,
• Modelos estocásticos espacio-temporales para el análisis de procesos dinámicos a partir de secuencias de imágenes. En concreto, se aplican metodologías estadísticas basadas en procesos germen-grano univariantes y bivariantes que se han empleado hasta el momento para modelizar procesos en biología celular analizando imágenes generadas por microscopio confocal.
• Recuperación de imágenes y formas basada en el contenido visual en grandes bases de datos de imágenes o formas, en general, no etiquetadas manualmente con texto descriptivo, con especial atención a bases de datos de morfometría humana y bases de datos de imágenes médicas. Esto apoya la organización y descripción semántica de los casos de estudio usados en líneas anteriores.
• Métodos de producción de software y modelado de la interacción de éste con el usuario. Esta línea transversal analiza y ordena el software producido (de hecho, el principal resultado aplicable de nuestra investigación) de modo que sea correcto, reusable, extensible y fácilmente manejable (en el caso de productos finales) por usuarios competentes en el contenido, pero no especializados en computación, en particular médicos o personal sanitario. La aplicabilidad de esta investigación se centra en el área biomédica, y tiene su fin último en la aplicación clínica, pero existen derivaciones interesantes en campos como la investigación básica en campos como la biología celular, o la ciencia de materiales y otras utilidades prácticas más directas como el diseño de redes de comunicación y redes de sensores, el diseño de ropa, los sistemas de recomendación de compras usando el aspecto visual de los objetos, etc.

Laboratorio autorizado para trabajar con bacterias fitopatógenas de cuarentena (condiciones de bioseguridad de nivel 2). 

Líneas de investigación: 

1. Caracterización y diagnóstico de bacterias patógenas de plantas.

• Descripción: Diagnóstico, caracterización e identificación convencional y molecular de bacterias patógenas de plantas (fitopatógenas). Tipificación molecular y epidemiología. 
• Actividades: Utilización de métodos moleculares rápidos y específicos para la detección y diagnóstico de bacterias fitopatógenas (de cuarentena como Erwinia amylovora y Ralstonia solanacearum y otras fitopatógenas en general como Lonsdalea quercina, Brenneria spp., etc).Estudios de epidemiología molecular para determinar variabilidad intraespecífica y vías de introducción/diseminación de patógenos bacterianos. Ensayos de virulencia y/o patogenicidad con distintas bacterias fitopatógenas. 

2. Estrategias de supervivencia de bacterias patógenas de plantas.

• Descripción: Estrategias de supervivencia bacteriana en distintos ambientes [supervivencia en condiciones oligotróficas, estado viable no cultivable (VNC) y factores inductores], reservorios y vías de transmisión. Recuperación de bacterias en estado VNC. Expresión génica y obtención de mutantes en genes bacterianos de interés. 
• Actividades: Estudios de supervivencia de bacterias fitopatógenas en microcosmos de agua natural y/u otros reservorios ambientales.Estudios de reservorios de bacterias fitopatógenas y vías de transmisión. Estudios de factores inductores de la entrada en el estado VNC. Estudios de recuperación y/o resucitación de células VNC. Estudios del efecto de factores bióticos y abióticos sobre la supervivencia y patogenicidad de bacterias fitopatógenas. Estudios del efecto de distintos factores de estrés en la expresión de genes relacionados con la supervivencia y/o virulencia de bacterias fitopatógenas. Obtención de mutantes en genes relacionados con la supervivencia y/o virulencia de bacterias fitopatógenas. Estudios de la supervivencia y virulencia de mutantes bacterianos de patógenos de plantas.Caracterización de mutantes bacterianos de patógenos de plantas por técnicas microbiológicas, microscópicas, moleculares y/u ómicas. 

3. Aplicaciones biotecnológicas de microorganismos ambientales.

• Descripción: Aislamiento y caracterización de microorganismos ambientales de interés biotecnológico: bacteriófagos, microorganismos productores de compuestos antimicrobianos, sideróforos, microorganismos degradadores. Control biológico de bacteriosis en plantas. 
• Actividades: Aislamiento y caracterización de bacteriófagos específicos de bacterias fitopatógenas. Estudios de supervivencia de bacteriófagos específicos de bacterias fitopatógenas. Aislamiento y caracterización de microorganismos productores de antimicrobianos y otros metabolitos de interés. Control biológico de enfermedades bacterianas de plantas.Aislamiento y caracterización de microorganismos ambientales degradadores de hidrocarburos. Estudio de las posibles aplicaciones en biorremediación. 

4. Bacteriología de líquenes. Aplicaciones biotecnológicas.

• Descripción: Aislamiento y caracterización de bacterias asociadas a líquenes: diversidad, contribución a la simbiosis liquénica y aplicaciones biotecnológicas. 
• Actividades: Aislamiento de bacterias asociadas a líquenes. Obtención de extractos liquénicos. Optimización de la recuperación de bacterias liquénicas. Diversidad de bacterias liquénicas. Papel de las bacterias asociadas a líquenes en las simbiosis liquénicas. Caracterización biotecnológica de bacterias liquénicas y sus aplicaciones: microorganismos promotores de crecimiento vegetal, degradadores de residuos, productores de nuevos polímeros, pigmentos,etc.

Las levaduras industriales, responsables de procesos biotecnológicos, son organismos muy especializados que han evolucionado bajo restrictivas condiciones ambientales en distintos ambientes manipulados por el hombre. Nuestro grupo está interesado en comprender los mecanismos implicados en su adaptación, que han modelado el genoma de las levaduras confiriéndoles propiedades de interés biotecnológico. Se utilizan distintas aproximaciones "ómicas" y el análisis evolutivo para entender los mecanismos de adaptación a cambios ambientales y nutricionales (temperatura, disponibilidad de nitrógeno y hierro, etc) de levaduras de interés industrial. Esta investigación es aplicable a la selección y mejora genética de nuevas cepas de levaduras de interés en fermentaciones industriales (vino, cerveza, sidra, etc) y la producción de suplementos dietéticos, por diferentes técnicas tales como, evolución adaptativa, hibridación, o el desarrollo de OMGs.

Nuestro grupo de trabajo está interesado en comprender los mecanismos moleculares implicados en los procesos de adaptación, que han modelado el genoma de las levaduras confiriéndoles unas propiedades tan peculiares de interés biotecnológico.

Los resultados de nuestra investigación son aplicables a los siguientes temas de interés para la industria:

• Aplicación de técnicas moleculares para la identificación y caracterización de levaduras en procesos fermentativos (principalmente vínicas y cerveceras).
• Selección de cultivos iniciadores para su uso en fermentaciones alcohólicas.
• Mejora genética de levaduras mediante técnicas no generadoras de OMGs tales como evolución dirigida, hibridación intra e inter-específica, así como mejora genética mediante ingeniería genética (OMGs). Estas técnicas se están aplicando a la mejora de levaduras vínicas y cerveceras para incrementar la producción de glicerol, para disminuir el rendimiento en etanol, para mejorar la tolerancia a bajas temperaturas, mejorar el crecimiento en condiciones limitantes de nitrógeno, mejorar la producción de aromas fermentativos y la liberación de aromas varietales.

Actividad investigadora centrada en la conservación y mejora de especies forestales y aromáticas. Comprende dos líneas subvencionadas por MINECO, UE y GVA (PrometeoII):

1. Biotecnología de especies forestales. Aplica la embriogénesis somática (ES) como herramienta para incrementar la resiliencia de especies forestales con vistas a una explotación forestal sostenible. En los últimos años, hemos optimizado protocolos de ES en Pinus pinaster (pino marítimo) y Quercus ilex (encina) destacando la selección de familias de Pinus pinaster con elevada capacidad embriogénica; la creación de un banco de germoplasma con estas líneas; la elaboración de protocolos de transformación genética en pino marítimo y pino piñonero; y la elaboración, por primera vez, de un protocolo para establecer líneas embriogénicas de genotipos adultos de encina. En el proyecto actual (AGL2013-47400-C4-4-R) se abordan dos estrategias para obtener genotipos tolerantes a estrés. Una aprovecha la variabilidad natural y utiliza los protocolos desarrollados para clonar y testar genotipos de encina con y sin síntomas de "la seca"; en la segunda, se pretende inducir memoria epigenética "priming" aplicando tratamientos de estrés biótico y abiótico durante las fase de proliferación-maduración. El proyecto también aborda varios aspectos fisiológicos y moleculares del proceso embriogénico como estrategia para mejorar las fases de inducción y maduración. Colaboramos con grupos nacionales expertos en ES en forestales del IMIDRA, el CSIC y Neiker. El grupo participa en las iniciativas nacionales y europeas que utilizan pino marítimo como modelo en coníferas para estudios de genómica funcional. En el proyecto SustainPine (Plant-KBBE, PLE2009-0016) generamos plantas transgénicas con niveles variables de expresión (sobreexpresión, o silenciamiento con RNAi) de genes implicados en crecimiento asociados al metabolismo del nitrógeno y que están en proceso de evaluación. Participamos además en el proyecto europeo ProCoGen (FP7-KBBE-2011-15) generando una línea celular haploide de pino marítimo que está siendo utilizada como fuente de DNA para la secuenciación de su genoma.
2. Ingeniería metabólica de terpenos. Estudia los mecanismos que regulan la síntesis y acumulación de terpenos en tricomas glandulares de espliego (Lavandula latifolia). Todos los terpenos derivan del precursor C5 IPP (isopentenil bifosfato) y su isómero DMAPP (dimetil alil bifosfato) que en plantas se puede sintetizar mediante dos rutas, la citoplasmática (ruta MVA) y la cloroplástica (ruta MEP). Para estudiar la contribución de ambas rutas a la producción final de aceite esencial, hemos sobreexpresado en espliego genes de Arabidopsis implicados en los primeros pasos de ambas rutas. Demostramos que la enzima 1-Deoxi-d-xilulosa-5-fosfato (DXP) sintasa (DXS), cataliza el primer paso de la ruta MEP, juega un papel crucial en la biosíntesis de IPP ya que su sobreexpresión incrementa la producción de aceite esencial en hojas. Por el contrario, la sobreexpresión de la enzima DXP reductoisomerasa (DXR) que cataliza la conversión de DXP en MEP no es una enzima limitante en el proceso. Las sobreexpresión de HMG1 (citoplasmática) también aumentó significativamente la producción de aceites esenciales sugiriendo una interconexión entre las dos rutas. Para estudiar la contribución de la ruta MVA a la biosíntesis del aceite de espliego se han realizado estudios con precursores marcados demostrando que aunque la ruta cloroplástica es la más importante, en condiciones determinadas puede haber flujo de IPP citoplasmático hacia el cloroplasto. También se ha modificado el perfil del aceite esencial, mediante la sobreexpresión de los genes linalol y limoneno sintasas sin alterar el contenido total de aceite. Se está optimizando la técnica de aislamiento de tricomas glandulares para completar estudios metabólicos.

Desde el año 2009 colaboramos con la empresa SAT Even 46 CV para producir plantas madre saneadas de variedades de adelfa.

La investigación del grupo de Control Biotecnológico de Plagas de la Universitat de València pretende optimizar las estrategias de Gestión Integrada diseñadas para el control de plagas de interés agronómico. La financiación del grupo se apoya en proyectos y contratos de investigación financiados por entidades públicas y privadas. Trabajamos concretamente en tres líneas de investigación, cuyos objetivos se resumen a continuación:

1. Estudio de las bases genéticas y bioquímicas de la resistencia a plaguicidas para retrasar su aparición y evitar el fenómeno de la resistencia cruzada.
2. Desarrollo de nuevos bioinsecticidas: Ampliación del espectro de acción conocido de B. thuringiensis y búsqueda de nuevos virus entomopatógenos.
3. Interacción insecto-patógeno: Identificación de los mecanismos implicados en la respuesta a patógenos.

La mujer presenta un perfil específico en muchas áreas del envejecimiento, incluyendo fragilidad, enfermedades crónicas (ejemplos de ello son claramente las enfermedades músculo-esqueléticas, las cardiovasculares, ciertas formas de cáncer, el deterioro cognitivo o la depresión), interacción social, y calidad de vida.

Nuestra actividad se ha focalizado en los determinantes femeninos de osteoporosis y enfermedades cardiovasculares, de la calidad de vida a partir de la menopausia, del deterioro cognitivo y, recientemente, de la fragilidad. Igualmente, y desde período más reciente, investigamos en la endometriosis, una enfermedad que origina morbilidad y afectación de la calidad de vida, y cuyo impacto en el envejecimiento saludable está empezando a conocerse en la actualidad.

Hemos hecho trabajo de investigación básica y aplicada, siendo por tanto un ejemplo de grupo multidisciplinar con interacción de investigadores básicos y clínicos y con un perfil de publicaciones y proyectos financiados que responden a ese criterio.

Grupo multidisciplinar de investigación biomédica constituido en 1998 dentro de la Unidad de Investigación EPIGEM (Epidemiología Genética y Molecular), reconocida en la Universitat de València. Este grupo fue reconocido por la Generalitat Valenciana en el año 2000 y también por la misma como grupo de excelencia en el año 2004. Desde entonces ha participado en la investigación sobre factores de riesgo genéticos y ambientales en la etiología de las enfermedades complejas, fundamentalmente enfermedades cardiovasculares y sus factores de riesgo incluyendo la obesidad, diabetes, dislipemias, etc. Desde el año 2003 forma parte del estudio PREDIMED y actualmente del estudio PREDIMED PLUS. Desde el año 2006 forma parte del CIBER Fisiopatología de la Obesidad y Nutrición. Posee más de 350 publicaciones en revistas científicas. Ha participado en más de 30 proyectos de investigación públicos y privados y es un grupo pionero en Genómica Nutricional.

El tono vascular depende de sustancias vasoactivas circulantes y de neurotransmisores liberados en la pared del vaso. El tono simpático es un componente fundamental de la resistencia vascular que puede estar influido por la presencia de un endotelio intacto, por lo que podría intervenir en patologías donde el tono simpático esté elevado, como en el espasmo local y en la hipertensión. Desde el comienzo de la formación del grupo de investigación uno de los principales objetivos ha sido iniciar las bases para conocer la participación del endotelio y del NO en la regulación nerviosa y hormonal del flujo sanguíneo en arterias y venas humanas de diversas regiones. También hemos podido comprobar que el endotelio y la liberación de NO no tienen un patrón común en los diversos lechos vasculares estudiados. Hemos valorado, mediante métodos indirectos, la actividad basal e inducida del óxido nítrico en diferentes lechos vasculares. El conocimiento de los mecanismos básicos que relacionan los factores endoteliales con la perfusión de diversos órganos o lechos vasculares humanos, nos permite conocer en el hombre la repercusión que el sistema endotelio-NO puede tener en la patología cardiovascular.

El papel modulador endotelial puede alterarse en diversas condiciones patológicas como la hiperreactividad bronquial, la hipertensión arterial, la resistencia a la insulina, el hipertiroidismo y la obesidad entre otras. Estas patologías comparten diversos factores de riesgo por lo que a menudo se pueden presentar asociadas. Por ejemplo, la obesidad está frecuentemente asociada a hipertensión y a un aumento del tono simpático. Por tanto, es posible que el estímulo adrenérgico de las arterias de resistencia se encuentre modificado como consecuencia de una alteración en la liberación de factores endoteliales. Lo mismo puede ocurrir con respecto a la respuesta frente a sustancias como la vasopresina, endotelina, tromboxano, angiotensina, directamente implicadas en la regulación de la circulación.

Hace unos años iniciamos estudios in vitro del efecto de inhibidores endógenos de la NO sintasa sobre la liberación de óxido nítrico endotelial y de sus efectos sobre la respuesta endotelio dependiente a la acetilcolina en pacientes con insuficiencia renal crónica y sometidos a hemodiálisis. También hemos podido comprobar la correlación entre la disfunción hepática y el incremento de la concentración plasmática de ADMA. En estudios con pacientes afectados de síndrome hepatorrenal (SHR) demostramos niveles elevados de ADMA y SDMA y correlaciones de SDMA con los niveles de alteración renal.

Nuestra experiencia indica que la contribución del endotelio varía en distintos lechos vasculares humanos con patología diversa. Dadas las limitaciones lógicas que presenta la experimentación en humanos, nuestros estudios en arterias y venas humanas se realizan mediante técnicas in vitro. Estos estudios tienen numerosas ventajas desde el punto de vista experimental, destacando especialmente la manipulación sencilla de las muestras vasculares y la posibilidad de llevar a cabo estudios farmacológicos con pocas limitaciones. Por razones éticas, no siempre los estudios se pueden realizar en muestras humanas. En estos casos hemos recurrido a diferentes modelos animales. Recientemente se ha añadido el estudio de los efectos vasculares de fármacos de nueva generación entre los que destacan bloqueantes de la corriente tardía de sodio, interacciones del levamisol con la cocaína, bloqueantes de la enzima degradante de la insulina o agonistas del PPARγ entre otros.

Los estudios de la reactividad vascular se han completado con determinaciones analíticas por técnicas de HPLC o colorimetría de sustancias que pueden interferir en el sistema vasodilatador endotelial dependiente del óxido nítrico (NOx, ADMA, SDMA, L-arginina entre otras) y determinaciones de expresión proteica y génica por técnicas de western Blot y de PCR.

Nuestra actividad investigadora se centra en estudiar mecanismos de patogénesis y en descubrir terapias farmacológicas potenciales para enfermedades raras de origen genético, en particular Distrofia Miotónica (DM1 y DM2), Atrofia Muscular Espinal (AME) y Distrofia Muscular de Cinturas (LGMDD2). Para ello empleamos Drosophila como modelo inicial de experimentación, cuyo genoma manipulamos para crear modelos adecuados para nuestos estudios. Aplicamos los resultados obtenidos en cultivos celulares, modelos murinos o muestras humanas. Uno de nuestros objetivos prioritarios es la identificación y desarrollo de fármacos tanto a partir de estrategias de reposicionamiento como de fármacos basados en oligonucleótidos de ARN.

El grupo de investigación denominado "Inmunología de las infecciones fúngicas", ha centrado su investigación, durante los últimos quince años, en el estudio de la respuesta inmunitaria del hospedador frente a Candida albicans. El grupo tiene formación multidisciplinar, tanto en el área de Microbiología como de Inmunología, por lo que presenta un perfil idóneo para estudiar las interacciones entre los hongos patógenos y las células del sistema inmunitario tanto in vitro como in vivo. Aunque la investigación realizada es fundamentalmente de carácter básico, tiene un claro potencial aplicado en el desarrollo de nuevas aproximaciones inmunoterapéuticas para el tratamiento de las infecciones fúngicas.

C. albicans es un patógeno oportunista que, dependiendo del defecto subyacente del hospedador, es capaz de causar una variedad de infecciones que van desde las candidiasis superficiales mucocutáneas a graves candidiasis invasivas. La frecuencia y gravedad de éstas últimas ha aumentado considerablemente en las últimas décadas, debido al aumento de la población de riesgo inmunodeprimida o debilitada por diferentes causas.

La resistencia a las candidiasis requiere la acción coordinada de las defensas inmunitarias innatas y adquiridas. Las células maduras del sistema inmunitario innato utilizan diferentes receptores PRRs (receptores de reconocimiento de patrones) para reconocer directamente MAMPs (patrones moleculares asociados a microorganismos), de manera que con un número limitado de estos receptores pueden reconocer una gran diversidad de agentes patógenos. Las familias de PRRs más importantes en el reconocimiento de C. albicans son los receptores tipo Toll (TLRs) y las lectinas tipo C (CLRs, como la dectina-1). En este contexto, nuestro grupo demostró que el receptor TLR2 está implicado en el reconocimiento de C. albicans, tanto levaduras como hifas, induciendo la secreción de citocinas y quimiocinas a través de una vía dependiente de la molécula adaptadora MyD88 y que dicho reconocimiento es crítico para la protección frente a la candidiasis invasiva en un modelo de infección en ratón. 

En el año 2006 se describió que las células madre y progenitores hematopoyéticos (HSPCs), de los que derivan todas las células del sistema inmunitario, expresan TLRs funcionales, y que la señalización vía TLRs en las células madre hematopoyéticas (HSCs) provoca su entrada en ciclo celular y su diferenciación hacia el linaje mieloide. Este descubrimiento abrió nuevas perspectivas en cuanto a las interacciones patógeno-hospedador, ya que estos receptores podrían participar en la modulación de la hematopoyesis en respuesta a los microorganismos durante una infección. En aquel momento nuestro grupo decidió estudiar la participación de los PRRs en la interacción de C. albicans con las HSPCs y sus consecuencias en la resolución de la infección. Trabajando en esta línea hemos demostrado que C. albicans induce la proliferación de HSPCs y su diferenciación hacia el linaje mieloide, tanto in vitro como in vivo. Esta respuesta requiere la señalización vía TLR2 y dectina-1, y da lugar a macrófagos funcionales que son capaces de internalizar y destruir levaduras, además de secretar citocinas inflamatorias. Estos resultados indican que los patógenos pueden ser directamente reconocidos por las HSPCs a través de los PRRs, promoviendo así la capacidad de reaprovisionamiento del sistema inmunitario innato durante una infección. Por lo tanto, estos receptores podrían ser, al menos en parte, responsables de la mielopoyesis de emergencia que ocurre durante la mayoría de las infecciones, incluidas las candidiasis invasivas.

Por otra parte, numerosos estudios recientes han puesto en duda el dogma de que la memoria inmunológica es una característica exclusiva de la inmunidad específica, ya que células de la inmunidad innata pueden exhibir cierta "memoria" y responder de forma diferente frente a un segundo encuentro con el mismo u otro estimulo microbiano. Por ejemplo, la exposición de monocitos y macrófagos a C. albicans aumenta su respuesta frente a un segundo encuentro (inmunidad entrenada, dependiente de dectina-1), mientras que ligandos de TLR4 o TLR2 confieren una menor respuesta inflamatoria a los macrófagos (tolerancia).

Paralelamente a los estudios sobre memoria de la inmunidad innata, nuestro grupo se planteó como nuevo objetivo estudiar la función de los fagocitos formados tras el contacto de las HSPCs con ligandos microbianos. Utilizando modelos in vitro e in vivo hemos demostrado que la estimulación de PRRs en las HSPCs afecta al fenotipo funcional de los macrófagos que generan posteriormente. Por lo tanto, nuestros resultados muestran que este nuevo concepto de "memoria" de la inmunidad innata puede aplicarse, no solo a las células mieloides maduras, sino también a las HSPCs, lo que contribuye a aumentar la durabilidad de la memoria innata en el tiempo.

En base a estos resultados, y a los de otros autores en esta misma línea, actualmente se asigna un papel activo a las HSPCs en la lucha contra la infección. La hipótesis en la que trabajamos actualmente es que las HSPCs pueden detectar directamente a los microorganismos y contribuir a la protección frente a la infección por diferentes mecanismos, incluyendo su capacidad de diferenciarse a células mieloides con un fenotipo mejorado para hacer frente al patógeno e iniciar la respuesta inmunitaria.

Los resultados ya obtenidos abren nuevas perspectivas, que pueden ser de gran interés en la intersección entre la Inmunología, la Microbiología y la Hematología. La existencia de nuevos mecanismos en la interacción hospedador-patógeno, y sus consecuencias en la modulación de la respuesta inmunitaria durante la infección, puede representar una nueva diana para la intervención frente a las infecciones graves potenciando la respuesta inmunitaria. Además, la modulación de la hematopoyesis por microorganismos podría desvelar nuevas estrategias para el tratamiento de enfermedades con alteraciones en la producción de células mieloides, como las leucemias mieloides.

Líneas de trabajo:

• Ecología y diversidad. Taxonomía. Métodos moleculares de detección e identificación. Estudios sobre la ecología de especies de levaduras y bacterias en el vino. Análisis taxonómicos y descripción de nuevas especies. Desarrollo de diversas metodologías para la detección, identificación y cuantificación de organismos presentes en el vino. Control de calidad. Control de implantación de cultivos iniciadores.
• Metabolismo de azúcares ácidos y aminoácidos en bacterias lácticas. Esta línea de trabajo está encaminada a conocer las capacidades de los microorganismos para utilizar sustratos presentes en el mosto o en el vino, a determinar cómo afectan estos sustratos al crecimiento de las bacterias, y a conocer el efecto de su utilización sobre las características del vino.
• Genética, genómica y proteómica de Oenococcus oeni. O. oeni es la especie responsable de la fermentación maloláctica en vinos, un proceso que mejora las cualidades de los vinos tintos de crianza. La mayor parte de los cultivos iniciadores malolácticos son cepas de esta especie. El objetivo de esta línea de trabajo es desarrollar herramientas para la manipulación genética de esta especie: plásmidos para el clonaje, mutantes malolácticos y sistemas de introducción del DNA, etc. Estudios de genómica comparativa para establecer relaciones entre genoma y resistencia a factores de estrés del vino.
• Fermentación maloláctica. Selección de cepas de O. oeni y de Lactobacillus plantarum como cultivos malolácticos. Desarrollo de estrategias avanzadas para llevar a cabo la fermentación maloláctica: células inmovilizadas, desacidificación continua, células no proliferantes. Adaptación de cepas a SO2 y pH.
• Selección y adaptación de bacterias y levaduras para mitigar los efectos del cambio climático. Corrección de desequilibrios en la composición de mostos y vinos. Acidificación biológica de los vinos. Disminución biológica del grado alcohólico.
• Sistemas microbianos o enzimáticos para eliminar aminas biógenas tóxicas de los alimentos. Búsqueda de cepas de bacterias lácticas capaces de degradar aminas biógenas en vinos. Búsqueda de enzimas responsables de la degradación de aminas biógenas. Desarrollo de sistemas celulares y enzimáticos que permitan su utilización en vinos y otros alimentos.

El objetivo principal de nuestro grupo de investigación es estudiar la plasticidad estructural del cerebro adulto. Analizamos este proceso a nivel de reorganización sináptica, remodelación de neuritas y espinas y producción/incorporación neuronal. En particular, estamos interesados en cómo esta plasticidad estructural está implicada en los trastornos psiquiátricos, como la esquizofrenia y la depresión mayor, y en su tratamiento. Para lograr este objetivo, utilizamos modelos animales de estos trastornos y material postmortem de pacientes psiquiátricos. Utilizamos diferentes cepas de ratones que expresan proteínas fluorescentes en poblaciones neuronales seleccionadas para visualizar la remodelación estructural, tanto en tejido fijo como en tiempo real, utilizando cultivos organotípicos y ventanas cerebrales.

El grupo de investigación en Procesos Electorales y Opinión Pública se centra en analizar, estudiar y encontrar soluciones para todos los problemas y cuestiones relacionadas con los procesos electorales y/o la medición y seguimiento de la opinión pública, aplicando las técnicas cuantitativas más avanzadas.

Entre sus principales campos de investigación se encuentran (aunque no se limitan a ellos) los siguientes: generación de predicciones electorales, inferencia del comportamiento individual de los electores, análisis de encuestas y sondeos, la propuesta de nuevas aproximaciones metodológicas para mejorar, reduciendo costes, la calidad de los métodos de muestreo, análisis semántico de opiniones y monitorización del sentimiento en la red, el estudio de las consecuencias de la no-respuesta y los sesgos introducidos durante todo el proceso de inferencia, la solución a los vacíos en las bases de datos, la integración de información local y global en la obtención de respuestas multinivel, y el desarrollo de teoría estadística y metodología.

El enfoque que se aplica en el grupo de investigación en Procesos Electorales y Opinión Pública es abierto, no está limitado por ninguna aproximación metodológica concreta y hace uso extensivo de las fuentes de información. Así, empleamos técnicas frecuentistas y bayesianas, aplicamos desde sencillos modelos de regresión lineal hasta complejas aproximaciones basadas en redes neuronales, wavelets o modelos autobinomiales, utilizamos explícitamente el componente espacial y/o temporal de la información, realizamos simulación vía cadenas de Markov de Monte Carlo o directamente por métodos de Monte Carlo, y alimentamos a nuestros modelos con datos de encuestas, resultados electorales registrados, informaciones periodísticas, opiniones en la red y/o estadísticas oficiales.

Los miembros del grupo están abiertos a trabajar con otros grupos y con empresas e instituciones y animan a los analistas interesados a ponerse en contacto para explorar las posibles vías de colaboración.

Nuestro grupo estudia cómo se adhieren las células a la matriz extracelular (ECM) y sus implicaciones. Las adhesiones célula-ECM modulan señales mecánicas y controlan la señalización por factores de crecimiento, determinando la supervivencia, diferenciación, migración y extravasación de las células. Las ECMs se organizan en entramados fibrilares de diversa complejidad a los cuales las células se adhieren mediante receptores de membrana especializados, como las integrinas, que actúan de nexo de unión con el citoesqueleto. Entre las proteínas y proteoglicanos que componen las ECMs es particularmente interesante la proteína fibronectina (FN) ya que ofrece múltiples motivos de adhesión celular y su polimerización es el paso inicial para la organización del resto de componentes de muchas ECMs, fundamentalmente las que propician el desarrollo embrionario y aquellas matrices transitorias que permiten la regeneración de tejidos y el desarrollo de tumores.

La FN se secreta en forma de dímero soluble y su polimerización depende de la célula, ya que solo si se une a integrinas y éstas se activan y estimulan la contractilidad del citoesqueleto se ejerce tracción sobre la FN permitiendo su desplegado y auto-polimerización. Las fibras de fibronectina están en continuo remodelado y la alteración de este proceso puede conducir a la fibrosis, artritis y a defectos en el desarrollo y angiogénesis.

En nuestro grupo hemos generado y analizado distintas cepas de ratones knock-in y condicionales que expresan fibronectina con mutaciones en residuos potencialmente críticos para la adhesión celular. Nos interesa conocer que adhesiones son realmente limitantes y cómo cada adhesión influye en el comportamiento celular y en la secreción, estructura, mantenimiento o rigidez de la ECM; factores que, en último término, determinan la formación y regeneración de tejidos. Estamos utilizando estos ratones para averiguar cómo son de esenciales in vivo proteínas o secuencias implicadas en la adhesión y para definir patologías que se producen por su deficiencia. Regiones de la FN que consideramos cruciales para su función:

1. el motivo RGD del módulo FNIII10 es la principal secuencia de adhesión a integrinas. La adhesión por FN-RGD es muy compleja: se ha dicho que es la única que permite la formación de polímeros de FN; une dos familias distintas de integrinas:
   1. el primero constituido por Alfa5Beta1 y AlfaIIbBeta3 (exclusiva de plaquetas);
   2. los dímeros que contienen Alfav, con funciones distintas aunque en muchos tejidos complementarias. Está descrito que en el primer grupo la adhesión se refuerza, en condiciones de tensión aumentada, por la unión de una secuencia de aminoácidos, denominada sitio sinérgico, que se localiza en el módulo FNIII9.
2. la región heparina II (módulos FNIII12-14) que, por una parte une Syndecan-4, otro receptor celular, y por otra une numerosos factores de crecimiento implicados en angiogénesis y proliferación celular, como la familia de FGF, la de TGFBeta y la de PDGF. De esta región se ha hipotetizado que permitiría la señalización por factores de crecimiento de forma cooperativa con la adhesión a RGD. Esta región tiene un particular interés en el área de la regeneración tisular.

Estamos interesados en la caracterización de las señales internas móviles que controlan la floración en las plantas. Hemos utilizado Arabidopsis thaliana para caracterizar los cambios metabólicos asociados a la transición floral mediante un enfoque de metabolómica y lipidómica. Estos enfoques han identificado una serie de vías metabólicas que se alteran en las plantas que experimentan la transición floral en comparación con las que permanecen en fase vegetativa. Actualmente estamos investigando la contribución de esas vías al control del tiempo de floración en Arabidopsis y explorando la posibilidad de que éstas representen vías conservadas que sean importantes para el control de este rasgo en las especies cultivadas. Este estudio se ha complementado con un análisis transcriptómico que muestra qué genes que regulan esas vías metabólicas aumentan o disminuyen su nivel de expresión durante la transición floral.

La integración de los datos metabólicos, lipidómicos y transcriptómicos nos ha proporcionado un sólido conjunto de información para desentrañar nuevas capas de complejidad en el control de la floración. Recientemente, también hemos desarrollado un enfoque proteómico cuantitativo para identificar proteínas y péptidos específicos del floema que podrían representar señales móviles que controlan no sólo la floración sino también otros procesos de desarrollo. Ya hemos identificado más de 100 proteínas del floema y estamos caracterizando su función y su potencial papel como reguladores del desarrollo.
 

El Grupo de Investigación en Terapias Moleculares está formado por investigadores básicos y clínicos de la Universidad de Valencia, el Hospital Universitario y Politécnico de La Fe, el Hospital Clínico Universitario de Valencia, el Hospital Universitario de la Ribera, el Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas y el Centro de Investigación Príncipe Felipe.

La composición multidisciplinar de este grupo, que incluye a expertos en biología molecular, bioinformática y biología computacional, oncología médica, cirugía, patología y nuevas tecnologías de alto rendimiento (genómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica), permite afrontar la complejidad molecular inherente a las enfermedades humanas, y la búsqueda de nuevas terapias desde una perspectiva integrativa y traslacional. Este abordaje está siendo aplicado en las diferentes líneas de investigación desarrolladas por el grupo, como son la identificación de nuevos biomarcadores y dianas moleculares para el tratamiento del cáncer de pulmón, la fisiopatología de la fibrosis pulmonar, o la prevención y terapia de las neuropatías hipóxico isquémicas.

Nuestro grupo trabaja en diferentes aspectos del tráfico de proteínas en células vegetales, con especial énfasis en estudios funcionales. Por una parte, tratamos de elucidar la función de un grupo de proteínas (de la familia p24) probablemente esenciales en el control de calidad del tráfico de proteínas en la vía secretora y en la organización de los compartimentos de la vía secretora temprana, incluyendo la bio génesis del complejo de Golgi. Por otra parte, estamos interesados en investigar las bases moleculares de la localización polar del transportador de auxinas PIN1, que determina el transporte polar de auxinas y es esencial para el crecimiento y desarrollo de las plantas, determinando su polaridad global.

El grupo de investigación UIRFIDE ha venido trabajando desde el año 1995 en las 3 grandes líneas clásicas que configuran el mundo del rendimiento físico y deportivo. La Gestión del Deporte y la Actividad Física, donde se investiga y se proponen intervenciones concretas sobre problemas como los relacionados con la calidad de los servicios deportivos o la gestión de eventos (desde pequeños eventos locales hasta grandes eventos internacionales). El Rendimiento Deportivo, donde de nuevo se investiga y se proponen intervenciones relacionadas con las necesidades de los deportistas de cara a mejorar su rendimiento, sea cual fuere su nivel de partida y su momento en la etapa evolutiva. Y, finalmente, sobre el mundo de la Actividad Física y la Salud, centrándose sobre todo en aquellas poblaciones algo más necesidades de adaptación en la práctica física y deportiva, como es el caso de los adultos mayores o las personas con discapacidad.