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Grupo de Investigación en Diversidad Microbiana y Taxogenómica de Procariotas - TAXGEN-PRO

Descripción

Estudios de diversidad procariótica de medios acuáticos (en especial marinos) y de taxonomía bacteriana.

  • Caracterización polifásica de bacterias y arqueas, especialmente marinas, con fines taxonómicos, descripción formal y conservación de nuevos taxones bacterianos y generación de bases de datos de utilidad en su identificación.
  • Caracterización fenotípica y funcional: caracteres culturales, estructurales, fisiológicos, bioquímicos y nutricionales, determinación de caracteres quimiotaxonómicos (ácidos grasos, lípidos polares, quinonas, proteínas mayoritarias mediante MALDI-TOF, G+C).
  • Genómica comparada aplicada a la taxonomía procariótica: obtención de datos (nuevas secuencias, ampliación y/o cerrado) de cepas tipo y nuevos aislamientos, Análisis comparativo y estudios filogenéticos basados en genes conservados (gen 16S rRNA, diversos genes esenciales), filogenómica basada en genomas completos. Determinación de valores de hibridación DNA-DNA in silico e índices ANI (Average Nucleotide Identity) y AAI (Average Aminoacid Identity) a partir de secuencias genómicas.
  • Aspectos formales: Nomenclatura en Taxonomía de procariotas. 

Grupos taxonómicos: preferentemente familias, géneros y especies de los filos Pseudomonadota (en especial familias Vibrionaceae, Halomonadaceae y Rhodobacteraceae) y Bacteroidota (orden Flavobacteriales), entre otros taxones.

Objetivos CT
  • Generación de conocimiento en torno a los recursos microbianos, su clasificación y conservación, incluyendo sus posibles aplicaciones biotecnológicas.
  • Desarrollo de metodologías de detección, identificación y cuantificación de microorganismos de importancia en alimentos.
Líneas de investigación
  • Genómica aplicada a la taxonomía procariota

    Estudios de aplicación de la genómica comparada a la taxonomía procariota. Incluye tanto la obtención de datos (nuevas secuencias, ampliación y/o cerrado) de cepas tipo y cepas adicionales de interés para el grupo así como su posterior análisis con herramientas informáticas y secuencias públicas.

  • Taxonomía de bacterias marinas

    Clasificación, identificación y nomenclatura de bacterias marinas: caracterización polifásica (fenotípica, genómica y filogenética), especialmente de alfa/gammaproteobacterias y bacteroidetes mediante MLSA, hibridación DNA-DNA, índices taxogenómicos y fenotipado clásico.

Dirección
  • PUJALTE DOMARCO, M JESUS
  • PDI-Catedratic/a d'Universitat
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Miembros
  • AZNAR NOVELLA, ROSA
  • PDI-Catedratic/a d'Universitat
  • Director/a de Servei General
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  • RUIZ ARAHAL, DAVID
  • PDI-Catedratic/a d'Universitat
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Producción científica por investigador UV
Estructura asociada
Datos de contacto del grupo
Diversidad Microbiana y Taxogenómica de Procariotas (TAXGEN-PRO)

Campus Burjassot/Paterna

Parque Científico
C/ Catedrático Agustín Escardino, 9

46980 Paterna (Valencia)

963 543 142

Geolocalización

www.uv.es

maria.j.pujalte@uv.es

Personas de contacto
  • PUJALTE DOMARCO, M JESUS
  • PDI-Catedratic/a d'Universitat
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