El actual Programa de Doctorado de Neurociencias de la Universitat de València (3142) resulta de la adaptación al EEES del Programa de Doctorado en Neurociencias de la Universitat de València, catalogado como Programa con Mención hacia la Excelencia (MEE2011-0485, según Resolución 16518 de 6 de octubre de 2011 de la Secretaría General de Universidades).
El anterior programa es el resultado de la fusión de dos programas previos de doctorado con Mención de Calidad, uno interdepartamental denominado Neurociencias Básicas y Aplicadas y otro Programa Interuniversitario, de Neurociencias de las Universidades de Murcia y Valencia. El Programa de Doctorado de Neurociencias Básicas y Aplicadas comenzó su andadura en 2001 y ha contado con la Mención de Calidad del Ministerio de Educación ininterrumpidamente desde 2003 (MCD 2003-00158), habiendo obtenido la mención de calidad en la primera convocatoria. El programa interuniversitario de Neurociencia de las Universidades de Murcia y Valencia contó con la mención de calidad desde la convocatoria 2003 (MCD2003-00120), aunque la Universidad de Valencia se incorporó en 2005, habiéndolo mantenido desde entonces, a pesar de haber quedado como universidad única en el ultimo año.
El actual Programa ha pretendido aglutinar todos los centros y grupos activos y relevantes en el campo de las Neurociencias del entorno de la ciudad de Valencia: Universitat de València, CSIC-IBV, CIPF, IISLAFE e INCLIVA. La vocación del programa ha sido y es la transversalidad de modo que en la mayor parte de equipos existen miembros procedentes de distintas áreas de conocimiento permitiendo proporcionar un enfoque multidisciplinar a su temática y línea particular.
