- Mecanismos que subyacen al proceso de autoorganización en ecosistemas.
- Procesos lacustres implicados en la desnitrificación del agua proveniente de los acuíferos.
- Contaminacion de las aguas dulces por nitratos: soluciones naturales y soluciones tecnologicas.
- Efectos de la pérdida y re-introducción de especies sobre la estructura, función y dinámica de sus comunidades.
- Fuentes y sumideros de carbono en el Parque Nacional de Las Tablas de Daimiel.
- Contaminación de las aguas dulces por nitratos: soluciones naturales y soluciones tecnológicas.
- Descontaminación de las aguas ricas en nitratos en el Campo de Montiel.
- Efecto de la pérdida y reintroducción de especies en la estructura, función y dinámica de los ecosistemas.
- Reintroducción de carófitos en ecosistemas acuáticos de la Comunidad Valenciana.
- Vulnerabilidad de ecosistemas acuáticos del Sur de la Península Ibérica frente a factores de cambio global. Radiación Ultravioleta y aporte de nutrientes minerales.
- El binomio fitoplancton-macrófitos sumergidos. Sus respuestas frente a cambios globales (aumento de la radiación ultravioleta y eutrofización) e implicaciones en la gestión de humedales.
- Seguimiento del plancton y la vegetación sumergida en un área restaurada (Tancat de la Pipa, PN Albufera de Valencia).