El primer objetiu del Màster és que els estudiants adquireixen coneixements i capacitats atribuïbles, amb un nivell d'excel · lència, en les malalties parasitàries humanes i animals. Aquest nivell ve avalat per la Menció de Qualitat obtinguda pel programa de doctorat de què deriva.

Un segon objectiu fa referència a la seva finalitat, formar investigadors per integrar-se o liderar grups de recerca d'universitats, altres organismes públics o privats, hospitals i afins, i departaments de R + D d'empreses.