Nuestro interés fundamental es conocer cómo responden las células a las señales que reciben modificando su expresión génica. Nuestro objetivo es abordar los cambios en la expresión génica estudiando sus distintas etapas, desde la activación transcripcional de los genes hasta la formación de moléculas de RNA mensajero y su traducción, prestando atención no solo a los factores implicados y los mecanismos, sino también a la conexión o crosstalk que se establece entre ellos y hace que la expresión génica no sea un proceso lineal sino interconectado hacia adelante y hacia detrás, en el tiempo y espacio.
Además, prestamos especial atención a algunos factores que parecen claves en el control de la expresión génica y que muchas veces actúan de forma multidisciplinar en varios procesos biológicos y distintos compartimentos celulares. Uno de esos factores es la proteína eIF5A, altamente conservada desde levaduras a humanos y esencial en las células eucariotas. eIF5A es un factor de elongación de la traducción necesario en la síntesis de proteínas que contienen motivos de amino ácidos con prolinas consecutivas o con combinaciones de prolinas, glicinas y amino ácidos cargados.
Nuestro interés es entender el mecanismo de regulación de la traducción por eIF5A, determinando cuáles son las proteínas cuya síntesis requiere de este factor y cómo, directamente o a través de sus dianas, eIF5A actúa en procesos patológicos como la fibrosis, el cáncer o durante el envejecimiento. En nuestro grupo utilizamos principalmente como organismo modelo la levadura Saccharomyces cerevisiae puesto que es el eucariota mejor conocido y modelo para la comprensión a nivel celular de procesos moleculares conservados evolutivamente. Además, comprobamos que las conclusiones de nuestra investigación se pueden generalizar a células de mamífero utilizando cultivos de células de ratón o humanas.
- Objetivo 1: Generación de técnicas de escala genómica y su utilización en la investigación de las diversas etapas y procesos de la expresión génica.
- Objetivo 2: Estudio del control de la traducción por el factor, conservado evolutivamente, eIF5A y su función en patologies.
- Estudio del control de la traducción por el factor, conservado evolutivamente, eIF5A y su función en patologías
eIF5A es un factor de elongación que se une a los ribosomas cuando éstos se atascan durante la síntesis de algunas proteínas que contienen motivos con prolinas, glicinas y amino ácidos cargados. Nuestro grupo ha determinado que eIF5A es necesario para la síntesis de forminas (de levadura, mosca y ratones), colágeno (de ratón y humanos) y proteínas humanas que tienen tendencia a la agregación en células envejecidas. Nuestro objetivo es determinar mecanísticamente la función de eIF5A, a través de la síntesis de sus proteínas diana, en patologías tales como la fibrosis, el cáncer o durante el envejecimiento. Comprender estos mecanismos ayudará al desarrollo de terapias específicas dirigidas a regular la función de eIF5A.
- Análisis genómico de la transcripción en levadura
La complejidad del fenómeno de la expresión génica se comprenderá mejor si se mejoran las técnicas para medir, al nivel genómico, la transcripción in vivo y se usan aproximaciones genéticas y genómicas para clarificar las conexiones funcionales que controlan la transcripción.
- PEREZ ORTIN, JOSE ENRIQUE
- PDI-Catedratic/a d'Universitat
- Coordinador/a de Programa de Doctorat
- Secretari/a d' Institut Universitari
- ALEPUZ MARTINEZ, ELIA PAULA
- PDI-Catedratic/a d'Universitat
- Coordinador/a de Mobilitat
- GARCIA MARTINEZ, JOSE
- PDI-Titular d'Universitat
- Director/a de Departament
- ContraerExpandirPEREZ ORTIN, JOSE ENRIQUEPDI-Catedratic/a d'UniversitatCoordinador/a de Programa de DoctoratSecretari/a d' Institut Universitari
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Victoria Begley; Daniel Corzo; Antonio Jordán-Pla; Abel Cuevas-Bermúdez; Lola de Miguel-Jiménez; David Pérez-Aguado; Mercedes Machuca-Ostos; Francisco Navarro; María José Chávez; José E. Pérez-Ortín; Sebastián Chávez(2019)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasNucleic Acids Research, 47(18), pp. 9524 - 9541. ISSN: 0305-1048
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M. Kelbert; A. Jordan-Pla; L. de-Miguel-Jiménez; J García-Martínez; M. Selitrennik; A. Gutman; N Henig; S Granneman; J.E. Pérez-Ortín; S. Chávez; M. Choder(2023)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasElife, 12(RP90766). ISSN: 2050-084X
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Otras Publicaciones
- ContraerExpandirGARCIA MARTINEZ, JOSEPDI-Titular d'UniversitatDirector/a de Departament
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Romero AM; Ramos-Alonso L; Montellá-Manuel S; García-Martínez J; de la Torre-Ruiz MÁ; Pérez-Ortín JE; Martínez-Pastor MT; Puig S(2019)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasBiochimica Et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms, 1862(9), p. 194414. ISSN: 1874-9399
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Vicente Arnau; Marina Barba-Aliaga; Gaurav Singh; Javier Ferri; José García-Martínez; José E. Pérez-Ortín(2022)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasPlos One, 17(9), p. e0272878. ISSN: 1932-6203
Shiladitya Chattopadhyay; Jose Garcia-Martinez; Gal Haimovich; Jonathan Fischer; Aya Khwaja; Oren Barkai; Silvia Gabriela Chuartzman; Maya Schuldiner; Ron Elran; Miriam I. Rosenberg; Shira Urim; Shubham Deshmukh; Katherine E. Bohnsack; Markus T. Bohnsack; Jose E. Perez-Ortin; Mordechai Choder(2022)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasNature Communications, 13(7184), pp. 1 - 17. ISSN: 2041-1723
Publicaciones en revistas
- ContraerExpandirTORDERA DONDERIS, VICENTEPDI-Catedratic/a d'Universitat
Doménech-Carbó A.; Cebrián-Torrejón G.; de Miguel L.; Tordera V.; Rodrigues-Furtado D.; Assad-Kahn S.; Fournet A.; Figadère B.; Vázquez-Manrique R.P.; Poupon E.(2014)dsDNA, ssDNA, G-quadruplex DNA, and nucleosomal DNA electrochemical screening using canthin-6-one alkaloid-modified electrodes.Electrochimica Acta, 115, pp. 546 - 552. ISSN: 0013-4686
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Vicente-Muñoz, S.; Romero, P.; Magraner-Pardo, L.; Martinez-Jimenez, C.P.; Tordera, V.; Pamblanco, M.(2014)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasFebs Open Bio, 4, pp. 996 - 1006. ISSN: 2211-5463
Benet M, Miguel A, Carrasco F, Li T, Planells J, Alepuz P, Tordera V, Pérez-Ortín JE.(2017)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasBiochimica Et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms, 1860, pp. 794 - 802. ISSN: 1874-9399
José E. Pérez-Ortín; Vicente Tordera; Sebastián Chávez(2019)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasRna Biology, 16, pp. 1659 - 1666. ISSN: 1547-6286
Pérez-Martínez M.E.; Benet M.; Alepuz P.; Tordera V.(2020)Grupo de Investigación en Genómica Funcional de LevadurasEpigenetics, 15(3), pp. 251 - 271. ISSN: 1559-2294
Publicaciones en revistas
Campus Burjassot/Paterna
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- PEREZ ORTIN, JOSE ENRIQUE
- PDI-Catedratic/a d'Universitat
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