El Instituto de Reconocimiento Molecular y Desarrollo Tecnológico se encuentra distribuido entre la Universidad Politécnica de Valencia (1ª y 2ª planta del edificio 5M y la 3ª planta de la Escuela Superior del Diseño en el Campus Vera) y la Universidad de Valencia (4ª planta del edificio de investigación y del edificio de Farmacia). Los laboratorios están equipados con todas las instalaciones necesarias para llevar a cabo labores habituales en relación a las líneas de Investigación que el Instituto desarrolla tales como síntesis, preparación de compuestos y materiales, caracterización, etc. (por ejemplo: vitrinas de extracción de gases, neveras y armarios de seguridad para almacenamiento de reactivos, equipo para operaciones de síntesis y purificación como agitadores, autoclaves, placas calefactores, rotavapores, bombas de vacío, sistemas de filtrado, equipos de cromatografía, etc.).
Además, el Instituto tiene acceso a equipos de caracterización y análisis tanto propios como de las Universidades, que cubren la mayor parte de las necesidades de investigación del Instituto.