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La Universitat de València y la Fundación Fisabio han participado en un estudio internacional que analiza el impacto de la metagenómica clínica en el diagnóstico de infecciones graves y su repercusión en la atención a los pacientes.
El trabajo, publicado en la revista The Lancet Infectious Diseases, revisa de forma sistemática más de un centenar de investigaciones para evaluar la utilidad de esta técnica en la práctica clínica. Los resultados muestran que la metagenómica clínica está ofreciendo buenos resultados en el diagnóstico de algunas infecciones respiratorias como neumonías graves o atípicas en pacientes ingresados en UCI. Además, está demostrando ser útil en casos complejos de meningitis o encefalitis cuando las pruebas microbiológicas tradicionales no logran detectar el origen de la infección.
La metagenómica clínica también ha resultado beneficiosa para el diagnóstico de precisión en pacientes oncológicos, personas trasplantadas o con sistemas inmunitarios muy debilitados, en quienes la detección rápida de cualquier patógeno es crítica para su supervivencia.
Por último, según el estudio, el uso más frecuente de esta prueba es el cribado rápido de infecciones difíciles de diagnosticar y de patógenos resistentes a fármacos. Esto permite al personal médico tanto tomar decisiones más rápidas sobre los tratamientos que recibían los pacientes, como ajustar, cambiar o retirar antibióticos.
Además, la revisión pone de manifiesto que esta técnica facilita la detección precoz de infecciones complejas y de microorganismos resistentes a los antibióticos, lo que permite ajustar antes los tratamientos y favorecer un uso más racional de estos medicamentos.
Una técnica con creciente aplicación clínica
La metagenómica clínica permite analizar el material genético presente en una muestra biológica e identificar virus, bacterias, hongos y otros microorganismos sin necesidad de sospechar previamente cuál puede ser el causante de la infección. Esta capacidad la convierte en una herramienta especialmente útil para el diagnóstico de infecciones complejas o de origen desconocido.
La evidencia científica acumulada respalda su rendimiento técnico, su utilidad manifiesta en diversos casos específicos y su potencial como prueba transformadora en el diagnóstico de enfermedades infecciosas. Xavier López Labrador, coautor del artículo, profesor titular en la Sección de Microbiología de la Facultad de Medicina de la Univestitat de València, y jefe del grupo Virología y Salud Pública del Área de Genómica y Salud de Fisabio, explica que la metagenómica clínica mediante secuenciación masiva “representa un enfoque diagnóstico transformador y su incorporación a la práctica clínica está en plena expansión".
Asimismo, señala que este trabajo “ofrece una visión del uso real de esta técnica en pacientes hospitalizados. La evidencia acumulada respalda su rendimiento técnico, demuestra su utilidad en distintos escenarios clínicos y confirma su potencial para transformar el diagnóstico de las enfermedades infecciosas".
López Labrador coordina, desde la Sociedad Europea de Virología Clínica (ESCV), el grupo de trabajo europeo sobre secuenciación masiva para el diagnóstico clínico.
Referencia del artículo: Brown J, Chiu C, López-Labrador F et al. (2026). “The impact of clinical metagenomic testing on patient management: facts versus fantasy”. The Lancet Infectious Diseases. DOI: 10.1016/S1473-3099(26)00106-4
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