La colección de rocas está muy bien representada con ejemplos de la mayoría de rocas sedimentarias, metamórficas y mágmáticas destacando ejemplares de arenisca con anillos de liesengang de la localidad de la Vall d'Uixó (Castellón) o las rocas volcánicas del cercano volcán de Cofrentes. El museo cuenta además con una diversa colección de rocas fosilíferas formadas por un gran porcentaje de éste tipo de restos.
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