L'equip permet l'obtenció de seqüències d'ADN pel mètode de Sanger i la determinació de la grandària de fragments.

L'equip de seqüenciació mitjançant electroforesi capil·lar ABI 3730XL s'utilitza en la seqüenciació convencional per la metodologia de Sanger i també en la determinació de la grandària de fragments de DNA marcats fluorescentment.

Conté un array de 96 capil·lars de 50 cm de longitud, la qual cosa permet analitzar 96 mostres simultàniament i obtindre seqüències d'una longitud d'al voltant de 900 pb.

El marcatge de les mostres per a la seqüenciació es realitza utilitzant didesoxinucleòtids marcats amb 4 fluorocroms diferents. Mitjançant l'electroforesi capil·lar es realitza la separació dels fragments marcats, que es detecten quan arriben al sistema òptic que està situat al final de l'array.

Per a les aplicacions de genotipat es poden utilitzar 5 fluorocroms diferents per a marcar els engreixadors utilitzats en l'amplificació dels fragments.