Un citòmetre d'imatge en flux és un dispositiu que combina citometria de flux i microscòpia per capturar imatges detallades de cèl·lules, permetent una anàlisi més completa de la seva morfologia i estructura.

La citometria d'imatge és una branca innovadora i tecnològicament avançada de la citometria de flux convencional, que es distingix per noves modificacions i millores en les tècniques existents. La citometria d'imatge proporciona informació àmplia sobre la morfologia o característiques estructurals de la cèl·lula. Això inclou una anàlisi detallada de la grandària, la forma, l'estructura interna i la distribució de components o marcadors específics dins de la cèl·lula. Per tant, la combinació de tecnologies d'imatge amb citometria de flux representa un gran avanç en l'anàlisi cel·lular, es té una font d'informació complementària per a validar les dades de fluorescència i proporcionar una caracterització completa de les poblacions cel·lulars. Este és un avanç significatiu respecte a la citometria de flux convencional, que es limita en gran manera a mesurar la intensitat de la fluorescència sense proporcionar cap imatge contextual de les estructures cel·lulars que produïxen estos senyals.