Aquest programa inclourà les línies pròpies de l'I²SysBio per a desenvolupar models matemàtics i computacionals de sistemes biològics, així com línies incloses en línies experimentals d'altres Programes Científics duts a terme en I²SysBio. En concret, està previst que projectes purament teòrics ajuden a explorar i centrar-se en línies experimentals en altres Programes Científics. S'encoratja als investigadors de les àrees de matemàtiques, física, informàtica o enginyeria a sumar-se a aquest programa.

Grups d'investigació

• Genòmica de l'Expresió Gènica
• Teoria, Bioinformàtica i Computació
• TheSimBioSys (Modelització Teórica i In Silico de Sistemes Biològics)
• Modelització en Biologia de Sistemes
• Panòmica i Microbiologia Evolutiva i de Sistemes