Logo de la Universitat de ValènciaLogo CSIC Logo del portal

 

Coordinat per l'Institut de Biologia Integrativa de Sistemes (I2SysBio) i la Universidad San Francisco de Quito. El projecte explora la presència de microorganismes amb potencial generador d'electricitat de les comunitats microbianes presents en els sediments de llacunes salades i salobres de l'illa Sant Cristóbal de l'arxipèlag de les Galápagos. Galápagos explora la producció d'electricitat de mostres ambientals, caracteritza el contingut metagenòmic de les comunitats microbianes i la correlació de la presència d'espècies electrogeneradores amb paràmetres ambientals com el pH, salinitat, temperatura i oxigen dissolt.
Coordinat per l'Institut de Biologia Integrativa de Sistemes I2SysBio) i la ICTS Laboratorio Subterráneo de Canfranc. El projecte estudia el contingut i la variabilitat espacial de les comunitats microbianes presents en mostres de roques calcàries del Pirineu a centenars de metres de profunditat gràcies a l'accés pel túnel de Somport, situat al Pirineu Central i que uneix les valls de l'Aragó (Espanya) i d'Asp (França). Gollum explora un ambient extrem poc conegut, caracteritzat per pocs nutrients, diversos substrats fisicoquímics, baixos nivells de qualsevol tipus de radiació i xicotetes fluctuacions tèrmiques. La presència d'ADN natiu i la identificació d'un alt contingut d'arqueges i la seua correlació amb metalls presents són alguns dels resultats més rellevants del projecte i obrin la possibilitat de múltiples qüestions, començant per resoldre si el material genòmic identificat correspon a ADN relíquia o per contra a microorganismes vius aïllats de l'exterior des de desenes de milions d'anys.
 

 

Els esdeveniments duplicats, des d'un gen fins a tot el genoma, generen una gran quantitat de material genètic i funcions innovadores en potència. L'omnipresència de la duplicació del gen en tots els nivells de la vida, incloent als organismes unicel·lulars i multicel·lulars, reforça la universalitat d'aquest fenomen. Per descomptat, la modularitat dels sistemes vius, des del nivell molecular-bioquímic al morfològic ha sigut guiada per esdeveniments de duplicació del gen o del genoma. No obstant això, encara que els investigadors coincideixen en l'existència d'una connexió entre la duplicació del gen i la innovació, els mecanismes subjacents encara no estan ben definits. En concret, els factors que determinen la destinació funcional de les còpies genètiques després de la seua duplicació continua sent debatible. El valor adaptatiu de majors dosis genètiques, el manteniment i el balanç estequiomètric, així com la robustesa de la mutació s'han presentat prèviament com els principals actors dels gens duplicats en el genoma.
Com a conseqüència de l'exposició als inductors d'estrés, les plantes reaccionen amb una resposta reguladora complexa que les adapta a condicions adverses. En general, aquestes condicions ambientals són els majors factors que limiten el desenvolupament i la productivitat de les espècies agrícoles. D'aquesta manera, la base molecular dels mecanismes que regulen la resposta a l'estrés s'ha estudiat àmpliament. Les condicions ambientals previsibles alterades arran del canvi climàtic suposen un gran repte per a la producció agrícola extensiva en un futur pròxim. En estar condicionades per aquest fenomen, s'han hagut d'aplicar estratègies innovadores que intenten entendre els mecanismes que es posen en marxa quan les plantes s'exposen a múltiples tipus d'estrés. No obstant això, comunament aquestes perspectives no se centren en els canvis produïts en el nivell de ARNs no codificats, encara que cada vegada més evidències li donen un paper primordial en els processos biològics de les plantes. Recentment hem identificat i caracteritzat xicotets ncRNAs (sncRNAs) que mostren diferents expressions associades a diverses condicions d'estrés. Arran d'aquestes evidències, hem inferit computacionalment una xarxa sncRNAs que va predir la regulació de la resposta de l'estrés en els melons. D'acord amb el nostre model funcional, aquesta xarxa reguladora està constituïda per sncRNAs específics (receptors d'estrés) que a través de sncRNAs intermedis difonen el senyal d'estrés induït al nucli sncRNAs que és responsable de regular la resposta a l'estrés. Arran d'això, determinem com a objectiu general de la nostra proposta el determinar i validar funcionalment les vies reguladores mitjançant sncRNAs vinculats a la resposta de l'estrés en les cucurbitàcies. Esperem utilitzar aquest coneixement per a millorar el desenvolupament d'eines biotecnològiques que augmenten la tolerància dels cultius a l'estrés múltiple.
 

 

El grup de la Dra. Mar Siles Lucas en la IRNASA maneja models in vitro i in vivo d'interaccions paràsit-hoste amb fasciola hepàtica, que podrien utilitzar-se per a avaluar el potencial del paràsit i les seues molècules per a modular les rutes d'entrada i les rutes d'inflamació rellevants en COVID-19. D'una banda, aquest paràsit ha demostrat la seua influència en l'expressió de les molècules relacionades amb l'endocitosi (per exemple, clatrines) en les cèl·lules epitelials de ratolins in vitro, rutes que poden ser pertinents per a l'entrada del SARS-Cov-2 en les cèl·lules humanes. A més, F. hepàtica dóna lloc a una resposta Th2 modificada sense el component inflamatori en el seu hoste in vivo, i aquesta modulació pot donar lloc a una resposta inflamatòria controlada a la COVID-19.
Les partícules d'interferència defectuoses (DIP) són formes degenerades de genomes virals que no es reprodueixen però que continuen sent infeccioses per la complementació amb el virus de tipus salvatge (TW). Les DIP exerceixen un paper important en la modulació del resultat de la infecció i les respostes immunitàries, i poden seleccionar-se artificialment per a reforçar la seua activitat d'interferència i suprimir la replicació del virus complet (partícules d'interferència terapèutica, o TIP per les seues sigles en anglés). Proposem produir DIPs durant la replicació del SARS-CoV-2 en cultiu cel·lular, purificar-les, provar els seus efectes antivirals i caracteritzar-les molecularment. El resultat del projecte serà un conjunt específic de TIPs per al SARS-CoV-2 que podria utilitzar-se immediatament per a tractar el COVID19.
Encara que el SARS-CoV-2 i uns altres coronavirus es transmeten fonamentalment de manera directa entre individus durant les fases epidèmiques, la permanència del virus en l'ambient té el potencial d'originar nous brots malgrat els esforços de mitigació desplegats. El SARS-CoV-1 es va detectar en aigües residuals d'hospitals a la Xina i es va demostrar que les partícules virals podien romandre infectives el suficient temps com per a constituir un risc.
Les infeccions bacterianes són responsables de les altes taxes de morbiditat i mortalitat a tot el món. L'aparició de ceps resistents als antibiòtics actuals representa una greu amenaça mundial. Les infeccions nosocomials representen probablement el major desafiament, en particular el grup ESKAPE constituït per enterococcus faecium, staphylococcus aureus, klebsiella pneumoniae, acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa i espècies de enterobacter. Es necessiten noves teràpies per a combatre aquests bacteris resistents, i els bacteriòfags representen una alternativa prometedora.
El projecte científic liderat per investigadors del Consell Superior d'Investigacions Científiques (CSIC) en col·laboració amb 40 hospitals de tota Espanya estudiarà els genomes comparats del nou coronavirus de pacients amb malaltia Covid19 per a entendre i predir l'evolució i epidemiologia del virus.
El projecte proposa una nova estratègia per al garbellat de fàrmacs i anticossos contra el coronavirus SARS-CoV-2. Es tracta d'una tecnologia innovadora per a garbellat de fàrmacs que utilitza un sistema econòmic, ràpid, segur i eficient per a avaluar tot tipus de compostos antivirals i anticossos que bloquegen l'entrada del virus SARS-CoV-2 en les cèl·lules humanes. La utilització de virus recombinants ha sigut emprada amb èxit en el garbellat de fàrmacs enfront de diferents virus d'importància mèdica, així com en el garbellat serològic. Els avantatges de la proposta estan ben fonamentades, destacant que aquesta tecnologia pot ser aplicable en el futur a altres virus que constituïsquen un problema de salut pública emergent.
Les defenses genòmiques contra els virus en les plantes són en realitat part d'un sistema interconnectat major i ben conservat que s'usa per a una gran quantitat de mecanismes en organismes eucariotes, i que inclou la regulació de l'expressió genètica pels endògens siRNA i altres tipus de ARN xicotets (sRNAs), la defensa contra els atacants genòmicos com les transposones i la creació de la heterocromatina.
Una conseqüència fonamental de la teoria darwiniana de l'evolució per selecció natural és l'explicació de l'adaptació com a resultat d'un procés natural. No obstant això, els mecanismes genètics subjacents no estan encara resolts i constitueixen un tema fonamental en Biologia Evolutiva. Les tècniques de Seqüenciació de Nova Generació (NGS) permeten abordar qüestions evolutives a una escala abans impensable. No obstant això, la ràpida evolució d'aquestes tecnologies dificulta molt la seua aplicació, sobretot en els seus aspectes analítics i bioinformàtics, ja que s'han de resoldre molts problemes i imprevistos de gestió, emmagatzematge, transmissió, anàlisi o interpretació, la qual cosa representa un desafiament molt important en aquest camp.
La tuberculosi continua sent la primera causa de mort adulta per un únic agent infecciós a tot el món, malgrat un segle d'investigació que ha donat lloc a valuoses eines per a reduir la mortalitat per tuberculosi. Per tant, es necessiten enfocaments innovadors per a pal·liar la dramàtica càrrega que suposa per a la humanitat el mal causat per la tuberculosi. El nostre coneixement de la interacció entre la virulència bacteriana i la immunitat humana continua sent insuficient en el context de la tuberculosi. Per tant, propose que s'estudien les associacions d'acolliment de patògens com a mitjà per a desxifrar els mecanismes, encara desconeguts, que subjauen a la tuberculosi a Àfrica.
Estem implementant una aproximació metagenòmica per al potencial establiment d'una estratègia de vigilància enfront de malalties virals emergents mitjançant l'ús de tècniques de seqüenciació massiva a partir de mostres de donants de sang de diferents centres nacionals.
Utilitzem l'evolució dirigida per a crear virus modificats que infecten de forma selectiva i destrueixen tumors (virus oncolítics). Tradicionalment, les cèl·lules cancerígenes mostren defectes innats d'immunitat, la qual cosa les fa altament susceptibles a infeccions virals. Gràcies a l'adaptació dels virus als tumors en un laboratori, és possible millorar l'habilitat d'aquest virus, en particular per a matar a les cèl·lules cancerígenes i estimular una resposta immune contra el tumor. Això podria obrir noves portes per al tractament del càncer. Actualment estem centrant els nostres esforços a estudiar els virus de la estomatitis vesicular, un virus ARN simple amb un tropisme natural cap a les cèl·lules cancerígenes.
El principal propòsit d'aquest projecte és determinar l'efecte de totes les mutacions possibles en un càpsida vírica i entendre com els diferents paràmetres cel·lulars i ambientals poden alterar la viabilitat de les mutacions en càpsides.
Les xaperones moleculars cel·lulars són un grup de proteïnes, ampli i abundant que supervisa els moviments de plec proteínics i ajuda a dur a terme l'homeòstasi proteínica. L'objectiu d'aquest projecte és definir a totes les xaperones i co-xaperones implicades en el procés de rèplica de virus respiratoris sincitials, que són els patògens respiratoris més importants entre els xiquets.
El principal objectiu d'aquest projecte és definir totes les co-xaperones Hsp90 implicades en el procés de rèplica de virus respiratoris sincitials, que són els patògens respiratoris més importants entre els xiquets.
Les resistències a antibiòtics i antivirals representen una de les majors amenaces per a la salut i un assumpte de gran importància econòmica, segons reconeixen organismes internacionals com l'OMS o l'OCDE. Sent el resultat de processos naturals però accelerats per la intervenció humana, són múltiples els factors que influeixen en la seua aparició i expansió. Per tant, les estratègies adoptades i en estudi per a controlar les resistències han de contemplar intervencions a diversos nivells. Des del grup d'investigació “Evolució i Salut” de la Universitat de València plantegem un projecte que integra dos de les nostres principals línies de treball, l'evolució experimental i l'epidemiologia molecular, en un únic objectiu: analitzar com optimitzar les estratègies d'administració de medicaments amb la finalitat de retardar o evitar l'expansió de resistències. Per a això, aplicarem diferents dissenys d'evolució experimental en condicions controlades de laboratori usant dos microorganismes diferents: un bacteri (Pseudomonas aeruginosa) i un virus d'RNA (rinovirus humà). El sistema experimental també contempla dos entorns bàsics, un in vitro (cultius) i un altre in vivo (usant el model murino per a tots dos patògens). El desenvolupament de les resistències serà avaluat funcionalment i s'analitzaran a intervals regulars l'aparició i dinàmica de variants genètics responsables de la resistència. Per a això emprarem tècniques d'ultra-seqüenciació que ens permetran avaluar la variabilitat genètica i la seua distribució al llarg del genoma de cada població, així com els efectes derivats de les mutacions de resistència.
S'assumeix generalment que les variacions genètiques en les espècies hoste per susceptibilitat a la infecció condicionaran necessàriament l'evolució de les poblacions de patògens, ja siga portant-los a la diversificació en soques que rastregen els al·lels defensius d'hoste (ex., diversitat antigenètica), o la canalització del patogen per a infectar únicament als genotips més susceptibles. Associada a aquest procés de diversificació o especialització, la virulència pot incrementar simultàniament. En qualsevol cas, l'aptitud dels patògens ha de ser millorada.
 

 

Un enorme creixement de la investigació sobre la microbiota intestinal, sovint utilitzant models de rosegadors, ha demostrat àmpliament l'enorme importància dels microorganismes prèviament abandonats per a la nostra salut. No obstant això, la complexitat del sistema planteja un desafiament formidable.
El projecte té com a objectiu, mitjançant un enfocament multidisciplinari i interinstitucional, fer front a la problemàtica que representen les malalties transmeses per dos complexos ambrosials (X. glabratus – R. lauricola i Euwallacea sp. – F. euwallaceae). Aquestes plagues es componen d'un escarabat escolítino que exerceix com a vector i transmet un o diversos fongs patògens que infecten a la planta hoste causant-li ràpidament el pansiment progressiu i finalment la seua mort.
L'objectiu principal és aprendre el paper que exerceix la comunicació de la ciència en l'origen de les creences, percepcions i coneixements relatius a les qüestions científiques. Per aconseguir aquest objectiu, durem a terme cinc consultes ciutadanes a Lisboa (Portugal), València (Espanya), Vicenza (Itàlia), Trnava (Eslovàquia) i Lodz (Polònia), amb la participació d'un total de 500 ciutadans sobre quatre temes científics "candents": vacunes, ús de medicines complementàries i alternatives, canvi climàtic, seguretat alimentària. L'objectiu dels investigadors és aprofundir en la comprensió de la ciència per part del públic i identificar els models actuals de comunicació científica.
La síndrome de Lynch (LS) és una afecció hereditària que implica un alt risc de càncer colorectal (CCR), càncer d'endometri i altres tumors. Presenta una herència dominant autosòmica i és causada per mutacions de la línia germinal en gens involucrats en el mecanisme de reparació d'errors que funciona durant la replicació del DNA [mismatch repair gens (MMR)].*LS té una penetrancia incompleta i una expressió variable. S'han descrit diferències significatives en el fenotip clínic dels pacients amb LS depenent del gen MMR que estiga mutat. Hi ha una gran heterogeneïtat en el risc de càncer en portadors de mutacions. Les causes d'aquesta heterogeneïtat són desconegudes, però poden deure's a gens modificadors de la penetrancia, canvis epigenètics i/o factors ambientals. Recentment, s'ha observat evidència d'un efecte beneficiós en ratolins model deficients en MMR i genèticament predisposats a CCR després de reduir si microbiota intestinal mitjançant el tractament amb antibiòtics i/o amb una dieta baixa en carbohidrats. Els derivats del metabolisme de carbohidrats, com el butirat generat per espècies del tall Firmicutes, són en última instància responsables del CCR en ratolins amb mutacions en MSH2. Aparentment, les alteracions específiques en la comunitat microbiana colorectal dels tractaments mencionats anteriorment resulten en una producció insuficient de metabòlits involucrats en les vies que contribueixen a la protecció contra la progressió del CCR. En aquesta proposta avaluarem l'impacte funcional de la microbiota en el desenvolupament de la oncogènesis colorectal en una cohort d'individus sans amb alt risc genètic de CCR.
El concepte de microbiota estable implica la idea que, després d'una pertorbació, la comunitat microbiana torna a la seua posició inicial en termes de composició (resiliència) o funció (redundància funcional) quan desapareix el factor pertorbador. Mitjançant l'aplicació d'un Nou mètode desenvolupat en el nostre grup, el programari Complex Cruncher, i mitjançant la determinació de la composició (metagenoma) i la funció (metatranscriptoma i metaboloma) de la microbiota intestinal, podem avaluar la seua estabilitat en un estudi longitudinal. Per a això, van participar voluntaris de la Comunitat Valenciana en aquest estudi, concretament 10 bebés, 10 adults i 10 ancians no relacionats i, d'altra banda, una cohort de 12 xiquets xicotets, 13 adolescents i 35 adults relacionats. Per cadascun dels voluntaris es va recol·lectar entre 8 i 10 mostres fecals i tots els procediments van ser revisats i aprovats per FISABIO.
Bacteris simbiòtics mutualistes, ja siguen intracel·lulars (endosimbionts) o comunitats de exosimbionts complexos localitzats en òrgans (com els intestins) dels hostes eucariotes poden ser explotades per a afectar els seus hostes per la modificació o la millora artificial de noves capacitats. Obtindre models experimentals robustos és de gran importància per a aconseguir un major coneixement d'aquests sistemes abans de manipular-los. En aquest projecte treballarem amb els endosimbionts Blattabacterium i exosimbionts del sistema digestiu de les paneroles Blattella germanica i les espècies seleccionades de Lepidòptera.
 

 

L'objectiu principal d'aquest projecte és aprofundir en la comprensió de les bases microbianes de l'endometriosi, analitzant els canvis i la relació entre el microbioma endometrial i el digestiu i determinant si les alteracions en la microbiota del tracte reproductiu i/o digestiu poden ser causants de l'endometriosi. Es pretén també avaluar l'efecte de bacteris probiòtics en models d'infecció endometrial com a possible tractament d'aquesta malaltia.
L'objectiu principal és aprendre el paper que exerceix la comunicació de la ciència en l'origen de les creences, percepcions i coneixements relatius a les qüestions científiques. Per aconseguir aquest objectiu, durem a terme cinc consultes ciutadanes a Lisboa (Portugal), València (Espanya), Vicenza (Itàlia), Trnava (Eslovàquia) i Lodz (Polònia), amb la participació d'un total de 500 ciutadans sobre quatre temes científics "candents": vacunes, ús de medicines complementàries i alternatives, canvi climàtic, seguretat alimentària. L'objectiu dels investigadors és aprofundir en la comprensió de la ciència per part del públic i identificar els models actuals de comunicació científica.
El projecte s'emmarca en la línia d'investigació continuada del grup que pretén aportar bases de coneixement i també estratègies tecnològiques derivades per a la millora de l'eficiència dels llevats vínics en tots els processos industrials en els quals participen: producció de biomassa de llevat sec actiu i fermentació vínica. Els objectius específics d'aquest projecte estan orientats a l'estudi de la integració de les diferents rutes de senyalització per nutrients i dels mecanismes d'adaptació a estrés oxidatiu en condicions industrials, i a la caracterització de l'adequació i millora tecnològiques de llevats no convencionals d'interés en enologia.
L'objectiu general és augmentar el coneixement sobre les comunitats bacterianes que viuen en superfícies artificials (plaques solars) en condicions extremes, de tal manera que puguem entendre els mecanismes moleculars que fan possible la seua supervivència i aplicar aquests coneixements per desenvolupar aplicacions biotecnològiques.
El principal objectiu és la identificació de microorganismes d'interès biotecnològic en una biocenosi totalment inexplorada: la superfície de les plaques solars. S'establirà una col·lecció de bacteris cultivables i pigmentats. Es procedirà a un cribratge de la seua activitat antioxidant en l'organisme model Caenorhabditis elegans i a una avaluació del seu contingut en carotenoides mitjançant HPLC.
 

 

No hi ha projectes