Les malalties humanes que s'originen en reserves no humanes, les zoonosis, constitueixen el 75% de les malalties infeccioses emergents i suposen una important amenaça per a la salut pública. En el cas particular de l'Ébola, l'epidèmia de 2014 a l'Àfrica occidental ha sigut la major registrada fins ara, afectant desenes de milers de persones amb taxes de mortalitat pròximes al 75%. A més, el virus de l'Ébola (EV) delma la població de grans simis, la qual cosa suposa un perill per a la conservació, representa una important amenaça a tot el món per la importació d'infeccions i el seu possible ús indegut com a arma biològica, i té conseqüències econòmiques i humanitàries dràstiques.

La generació d'alteracions mitòticament estables en l'expressió dels gens a causa de marques epigenètiques és una manera ràpida i relativament duradora d'establir una memòria genòmica dels esdeveniments d'estrés passats. La desregulació desencadenada pel medi ambient dels factors genètics associats a les maquinàries epigenètiques també pot donar lloc a una plasticitat fenotípica i a la mitigació de l'estrés. Per tant, la maquinària epigenètica de l'hoste pot suposar una pressió selectiva important, però en gran manera no mesura, sobre els patògens. Els virus de les plantes ofereixen un model convenient per a estudiar aquest tipus d'interaccions. En primer lloc, es proposa un experiment d'evolució a gran escala per a comprovar com evolucionen i interactuen les poblacions de virus en plantes amb vies epigenètiques compromeses o millorades. Les plantes de Arabidopsis thaliana amb mutacions en gens clau associats a marques de cromatina actives o repressives, inclosa la metilació de l'ADN i la modificació de les histones, s'enfrontaran a llinatges independents del virus del mosaic del nap (TuMV).

La seqüenciació massiva en paral·lel o de nova generació (NGS) ha suposat una revolució en els estudis genètics, tenint importants aplicacions en investigació i en clínica. Algunes són l'estudi del genoma, transcriptoma, microbioma, metiloma, el diagnòstic genètic i de medicina personalitzada, com farmacogenètica i la detecció de marcadors tumorals somàtics, estudis de mutacions tumorals en ADN circulant, determinació de la taxa de mutació per a estudis d'immunoteràpia per a oncologia. Una aplicació important és l'estudi de regions concretes del genoma per a molts dels estudis clínics o d'investigació, principalment d'un o diversos gens (panell de NGS) a causa dels elevats costos d'estudis de genoma complet.

La resistència als antibiòtics i l'enginyeria de teixits/medicina regenerativa han sigut reconegudes com dues dels grans reptes d'investigació de la Biotecnologia. Encara que aparentment inconnexos, argumentem que proporcionar respostes quantitatives a aquestes qüestions requereix un enfocament comú des del punt de vista de la mecanobiologia. D'una banda, la lectura fenotípica característica de la resistència als antibiòtics (i més en general de la resposta a l'estrés en els bacteris) és la filamentació.

L'habilitat de resoldre estructures poblacionals en alta resolució i profunditat és essencial per a comprendre l'evolució viral i la patogènesi. En aquest projecte implementem tècniques de seqüenciació basades en una extrema fidelitat cap a l'última generació per a poder abordar les qüestions clau de l'evolució viral i la patogènesi.

Contracte d'assessorament i suport tècnic amb Empresa EVERIS.

Coordinat per l'Institut de Biologia Integrativa de Sistemes (I2SysBio) i la Universidad San Francisco de Quito. El projecte explora la presència de microorganismes amb potencial generador d'electricitat de les comunitats microbianes presents en els sediments de llacunes salades i salobres de l'illa Sant Cristóbal de l'arxipèlag de les Galápagos. Galápagos explora la producció d'electricitat de mostres ambientals, caracteritza el contingut metagenòmic de les comunitats microbianes i la correlació de la presència d'espècies electrogeneradores amb paràmetres ambientals com el pH, salinitat, temperatura i oxigen dissolt.

Coordinat per l'Institut de Biologia Integrativa de Sistemes I2SysBio) i la ICTS Laboratorio Subterráneo de Canfranc. El projecte estudia el contingut i la variabilitat espacial de les comunitats microbianes presents en mostres de roques calcàries del Pirineu a centenars de metres de profunditat gràcies a l'accés pel túnel de Somport, situat al Pirineu Central i que uneix les valls de l'Aragó (Espanya) i d'Asp (França). Gollum explora un ambient extrem poc conegut, caracteritzat per pocs nutrients, diversos substrats fisicoquímics, baixos nivells de qualsevol tipus de radiació i xicotetes fluctuacions tèrmiques. La presència d'ADN natiu i la identificació d'un alt contingut d'arqueges i la seua correlació amb metalls presents són alguns dels resultats més rellevants del projecte i obrin la possibilitat de múltiples qüestions, començant per resoldre si el material genòmic identificat correspon a ADN relíquia o per contra a microorganismes vius aïllats de l'exterior des de desenes de milions d'anys.

Els canvis en les plantes induïts per l'estrés (inclosos els produïts per plagues o patògens) generalment es detecten per l'aparició de símptomes visuals, generalment una vegada que els efectes adversos en la producció del cultiu s'han tornat irreversibles.

Les malalties humanes que s'originen en reserves no humanes, les zoonosis, constitueixen el 75% de les malalties infeccioses emergents i suposen una important amenaça per a la salut pública. En el cas particular de l'Ébola, l'epidèmia de 2014 a l'Àfrica occidental ha sigut la major registrada fins ara, afectant desenes de milers de persones amb taxes de mortalitat pròximes al 75%. A més, el virus de l'Ébola (EV) delma la població de grans simis, la qual cosa suposa un perill per a la conservació, representa una important amenaça a tot el món per la importació d'infeccions i el seu possible ús indegut com a arma biològica, i té conseqüències econòmiques i humanitàries dràstiques.

La resistència als antibiòtics i l'enginyeria de teixits/medicina regenerativa han sigut reconegudes com dues dels grans reptes d'investigació de la Biotecnologia. Encara que aparentment inconnexos, argumentem que proporcionar respostes quantitatives a aquestes qüestions requereix un enfocament comú des del punt de vista de la mecanobiologia. D'una banda, la lectura fenotípica característica de la resistència als antibiòtics (i més en general de la resposta a l'estrés en els bacteris) és la filamentació.

Les situacions d'estrés ambiental (afavorides en gran part pel canvi climàtic) limiten el potencial productiu de múltiples espècies agrícoles. Enfront de situacions ambientals adverses la planta posa en marxe múltiples processos de regulació de l'expressió gènica amb l'objectiu de contrarestar aquests efectes. En nodrisc grup estudiem com aquestes complexes Xarxes Reguladores influenciades per l'Ambient exerceixen un funció clau en la modulació de les interaccions planta-ambient. Aquest projecte té com a objectiu comprendre com els processos que ocorren simultàniament a 3 nivells reguladors diferents (siRNAnoma, transcriptoma i epigenoma) modulen la resposta de la planta de meló a estrés. Aquest coneixement permetrà el desenvolupament d'estratègies globals i innovadores de protecció de cultius.

Les tècniques tradicionals de diagnòstic d'infeccions virals en la clínica es basen en procediments de (RT-)PCR, que porten molt temps i requereixen equip i recursos humans molt precisos, la qual cosa impedeix una intervenció ràpida i massiva. En aquest article, dissenyarem una nova classe de biosistemes autònoms destinats a diagnosticar la presència del SARS-CoV-2. Aquests biosistemes consisteixen en tres passos de reacció després de la recollida de la mostra sense necessitat d'un equip sofisticat: i) amplificació isotèrmica de l'ARN viral, ii) detecció d'àcids nucleics basada en el CRISPR (que funciona com una reacció de seqüenciació sobre la marxa), i iii) revelació de resultats mitjançant un assaig inmunocromatogràfic.

Els metabòlits secundaris influeixen en les característiques qualitatives del menjar com el color, el sabor i l'aroma, i representen les bases del desenvolupament de fàrmacs novells. Pretenem desxifrar les xarxes genètiques reguladores dels metabòlits secundaris que es basen en l'ús d'aproximacions multiòmiques per a determinar com els factors de transcripció controlen aqueixes rutes.

El material genètic pot programar-se per a crear sistemes que detecten, processen (d'acord amb càlculs lògics) i responguen (en forma d'expressió genètica) a diferents senyals moleculars. La biologia sintètica pretén aproximar-se a aquest concepte seguint els principals sistemes d'enginyeria, és a dir, a través de la combinació dels models matemàtics per a capturar les dinàmiques d'expressió genètica, els experiments per a monitorar quantitativament les característiques del sistema per a valorar el procés de disseny i l'estandardització genètica de la componibilitat modular. Per descomptat, el disseny dels circuits de disseny depén dels models incomplets o simples establits per desenvolupaments moleculars i de sistemes biològics previs. Una vegada dissenyat i caracteritzat per a la seua funció principal, el circuit sintètic encara presenta diversos interrogants, sovint passats per alt. Per exemple, els models que s'utilitzen per a guiar el disseny són prou predictius? El seu comportament és consistent a nivell poblacional o de cèl·lules individuals? Quina és l'estabilitat evolutiva d'un constructe sintètic en un organisme viu? Creiem que la solució adequada d'aquestes qüestions conduirà a una nova síntesi en la nostra forma d'entendre el seu funcionament.

Els nous avanços en biologia permeten l'enginyeria activa de proteïnes i cèl·lules per a l'aplicació de noves estratègies de biologia terapèutiques, analítiques i sintètiques. Atès que es calcula un mercat valorat en milers de milions de dòlars en 2020, l'educació i la recerca formal en aquests camps no està encara prou establerta a l'Europa continental i requereix habilitats interdisciplinàries que combinin la biologia, la química, la informàtica i les principals enginyeries. RNAct crea una plataforma extensa i multidisciplinària per a entrenar i guiar als ESRs en les habilitats informàtiques i d'experimentació versàtil necessàries en aquest camp intrínsecament multidisciplinari. RNAct permet al ESRs experimentar en llocs industrials i acadèmics per a desenvolupar les habilitats bàsiques que necessitaran per a treballar i per a comunicar el seu coneixement. RNAct fa ús de la biologia informàtica, estructural i molecular per a dissenyar i caracteritzar l'estructura i la funció de les dinàmiques proteiques, amb oportunitats de validació i innovació en cèl·lules analítiques, terapèutiques i de biologia sintètica, que ajudaran la recerca i a establir companyies capdavanteres en aquestes àrees competitives. Ens centrem especialment en el Disseny de Reconeixement ARN (RRMs), que són dominis proteics altament dinàmics per a la unió de forma versàtil del ARN. Els RRMs juguen un paper fonamental en la regulació de l'ARN cel·lular, amb una capacitat d'unió d'ARN altament versàtil. Podrien tenir un paper essencial en la biologia sintètica.

Els esdeveniments duplicats, des d'un gen fins a tot el genoma, generen una gran quantitat de material genètic i funcions innovadores en potència. L'omnipresència de la duplicació del gen en tots els nivells de la vida, incloent als organismes unicel·lulars i multicel·lulars, reforça la universalitat d'aquest fenomen. Per descomptat, la modularitat dels sistemes vius, des del nivell molecular-bioquímic al morfològic ha sigut guiada per esdeveniments de duplicació del gen o del genoma. No obstant això, encara que els investigadors coincideixen en l'existència d'una connexió entre la duplicació del gen i la innovació, els mecanismes subjacents encara no estan ben definits. En concret, els factors que determinen la destinació funcional de les còpies genètiques després de la seua duplicació continua sent debatible. El valor adaptatiu de majors dosis genètiques, el manteniment i el balanç estequiomètric, així com la robustesa de la mutació s'han presentat prèviament com els principals actors dels gens duplicats en el genoma.

Com a conseqüència de l'exposició als inductors d'estrés, les plantes reaccionen amb una resposta reguladora complexa que les adapta a condicions adverses. En general, aquestes condicions ambientals són els majors factors que limiten el desenvolupament i la productivitat de les espècies agrícoles. D'aquesta manera, la base molecular dels mecanismes que regulen la resposta a l'estrés s'ha estudiat àmpliament. Les condicions ambientals previsibles alterades arran del canvi climàtic suposen un gran repte per a la producció agrícola extensiva en un futur pròxim. En estar condicionades per aquest fenomen, s'han hagut d'aplicar estratègies innovadores que intenten entendre els mecanismes que es posen en marxa quan les plantes s'exposen a múltiples tipus d'estrés. No obstant això, comunament aquestes perspectives no se centren en els canvis produïts en el nivell de ARNs no codificats, encara que cada vegada més evidències li donen un paper primordial en els processos biològics de les plantes. Recentment hem identificat i caracteritzat xicotets ncRNAs (sncRNAs) que mostren diferents expressions associades a diverses condicions d'estrés. Arran d'aquestes evidències, hem inferit computacionalment una xarxa sncRNAs que va predir la regulació de la resposta de l'estrés en els melons. D'acord amb el nostre model funcional, aquesta xarxa reguladora està constituïda per sncRNAs específics (receptors d'estrés) que a través de sncRNAs intermedis difonen el senyal d'estrés induït al nucli sncRNAs que és responsable de regular la resposta a l'estrés. Arran d'això, determinem com a objectiu general de la nostra proposta el determinar i validar funcionalment les vies reguladores mitjançant sncRNAs vinculats a la resposta de l'estrés en les cucurbitàcies. Esperem utilitzar aquest coneixement per a millorar el desenvolupament d'eines biotecnològiques que augmenten la tolerància dels cultius a l'estrés múltiple.

L'emergència de bacteris multiresistents és un problema de salut pública mundial que requereix la cerca i desenvolupament de tractaments alternatius. Els fags, virus de bacteris, es postulen com una eina de biocontrol efectiva, gràcies a les seues propietats intrínseques com l'alta especificitat i la la seua capacitat evolutiva, així com ser ecològicament segurs.

El projecte SUPERFAGO forma part d'una iniciativa per a donar a conéixer a la ciutadania el potencial de la teràpia amb fags per a combatre les infeccions per bacteris resistents als antibiòtics, conegudes popularment com "superbacteris".

El mal ús dels antibiòtics ha fomentat l'emergència de bacteris patògens multiresistents, sent un problema de salut global a causa de l'absència de tractaments efectius.

La detecció de virus patògens per a humans en aigües residuals és una eina molt útil i coneguda per a la vigilància epidemiològica.

Els objectius d'aquesta plataforma seran la identificació de mutacions associades a canvis epidemiològics/clínics de SARS-CoV-2 amb especial atenció a la fallada vacunal.

El medi ambient és un factor clau en el resultat de les interaccions entre el virus i l’hoste, que pot acabar modificant el resultat de la infecció i la gravetat. En efecte, s’ha demostrat en diferents organismes que la microgravetat afecta a la seua immunitat.

Som part d'un esforç conjunt centrat en comprendre millor els efectes de les mutacions en el SARS-CoV-2 en temps real. Aquesta beca busca establir una plataforma per a bregar amb amenaces actuals i futures.

Som part d'un esforç conjunt centrat en establir una plataforma per al garbellat d'antivirals contra amenaces víriques actuals i futures. El treball combina grups que s'encarreguen del sencer procés de descobriment i desenvolupament de fàrmacs.

L'emergència de bacteris multiresistents a antibiòtics és un dels principals problemes de salut pública. L'Organització Mundial de la Salut ha elaborat una llista de bacteris patògens multiresistents, entre les es troben patògens nosocomials de prioritat crítica que poden provocar infeccions greus i sovint letals, com és el cas de Klebsiella pneumoniae.

El SARS-CoV-2 és principalment un virus respiratori, encara que s'ha demostrat que pot replicar en la mucosa intestinal, i ser excretat via fecal. Dades moleculars han demostrat la presència de material genètic del virus en femta, mentre que els estudis de detecció de partícules virals infectives són encara incipients i, basats en un número molt xicotet de pacients.

La generació d'alteracions mitòticament estables en l'expressió dels gens a causa de marques epigenètiques és una manera ràpida i relativament duradora d'establir una memòria genòmica dels esdeveniments d'estrés passats. La desregulació desencadenada pel medi ambient dels factors genètics associats a les maquinàries epigenètiques també pot donar lloc a una plasticitat fenotípica i a la mitigació de l'estrés. Per tant, la maquinària epigenètica de l'hoste pot suposar una pressió selectiva important, però en gran manera no mesura, sobre els patògens. Els virus de les plantes ofereixen un model convenient per a estudiar aquest tipus d'interaccions. En primer lloc, es proposa un experiment d'evolució a gran escala per a comprovar com evolucionen i interactuen les poblacions de virus en plantes amb vies epigenètiques compromeses o millorades. Les plantes de Arabidopsis thaliana amb mutacions en gens clau associats a marques de cromatina actives o repressives, inclosa la metilació de l'ADN i la modificació de les histones, s'enfrontaran a llinatges independents del virus del mosaic del nap (TuMV).

El grup de la Dra. Mar Siles Lucas en la IRNASA maneja models in vitro i in vivo d'interaccions paràsit-hoste amb fasciola hepàtica, que podrien utilitzar-se per a avaluar el potencial del paràsit i les seues molècules per a modular les rutes d'entrada i les rutes d'inflamació rellevants en COVID-19. D'una banda, aquest paràsit ha demostrat la seua influència en l'expressió de les molècules relacionades amb l'endocitosi (per exemple, clatrines) en les cèl·lules epitelials de ratolins in vitro, rutes que poden ser pertinents per a l'entrada del SARS-Cov-2 en les cèl·lules humanes. A més, F. hepàtica dóna lloc a una resposta Th2 modificada sense el component inflamatori en el seu hoste in vivo, i aquesta modulació pot donar lloc a una resposta inflamatòria controlada a la COVID-19.

Les partícules d'interferència defectuoses (DIP) són formes degenerades de genomes virals que no es reprodueixen però que continuen sent infeccioses per la complementació amb el virus de tipus salvatge (TW). Les DIP exerceixen un paper important en la modulació del resultat de la infecció i les respostes immunitàries, i poden seleccionar-se artificialment per a reforçar la seua activitat d'interferència i suprimir la replicació del virus complet (partícules d'interferència terapèutica, o TIP per les seues sigles en anglés). Proposem produir DIPs durant la replicació del SARS-CoV-2 en cultiu cel·lular, purificar-les, provar els seus efectes antivirals i caracteritzar-les molecularment. El resultat del projecte serà un conjunt específic de TIPs per al SARS-CoV-2 que podria utilitzar-se immediatament per a tractar el COVID19.

Des de 1999, C. elegans s'ha utilitzat àmpliament per a estudiar les interaccions entre microbis i hostes a causa del seu senzill cultiu, la seua traçabilitat genètica i la seua susceptibilitat als patògens bacterians i fúngics. En canvi, els estudis dels virus s'han vist obstaculitzats per la falta de models convenients d'infecció de virus en els nematodes. El descobriment d'un patogen viral natural de C. elegans i el desenvolupament de diversos models artificials d'infecció estan oferint noves oportunitats per a explorar la interacció virus-hospedant en aquest poderós organisme model.

Encara que el SARS-CoV-2 i uns altres coronavirus es transmeten fonamentalment de manera directa entre individus durant les fases epidèmiques, la permanència del virus en l'ambient té el potencial d'originar nous brots malgrat els esforços de mitigació desplegats. El SARS-CoV-1 es va detectar en aigües residuals d'hospitals a la Xina i es va demostrar que les partícules virals podien romandre infectives el suficient temps com per a constituir un risc.

En aquesta col·laboració s'aplicarà un enfocament multidisciplinari per a identificar els inhibidors de la unió i l'entrada del receptor del SARS-CoV-2. Combinant els coneixements de la química mèdica, la biologia química computacional, la biologia estructural i la virologia, s'empraran tres enfocaments paral·lels: 1) Assaig immediat de les biblioteques de compostos (>1.400) mitjançant un assaig cel·lular d'alt rendiment per a la unió i entrada del receptor del SARS-CoV-2. 2) Examen i disseny, síntesi i avaluació computacionals (3). Desenvolupament d'inhibidors basats en proteïnes derivats del receptor ACE2. L'avaluació final dels èxits quant a eficàcia i resistència als medicaments es farà amb el SARS-CoV-2.

Les infeccions bacterianes són responsables de les altes taxes de morbiditat i mortalitat a tot el món. L'aparició de ceps resistents als antibiòtics actuals representa una greu amenaça mundial. Les infeccions nosocomials representen probablement el major desafiament, en particular el grup ESKAPE constituït per enterococcus faecium, staphylococcus aureus, klebsiella pneumoniae, acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa i espècies de enterobacter. Es necessiten noves teràpies per a combatre aquests bacteris resistents, i els bacteriòfags representen una alternativa prometedora.

El projecte científic liderat per investigadors del Consell Superior d'Investigacions Científiques (CSIC) en col·laboració amb 40 hospitals de tota Espanya estudiarà els genomes comparats del nou coronavirus de pacients amb malaltia Covid19 per a entendre i predir l'evolució i epidemiologia del virus.

El projecte proposa una nova estratègia per al garbellat de fàrmacs i anticossos contra el coronavirus SARS-CoV-2. Es tracta d'una tecnologia innovadora per a garbellat de fàrmacs que utilitza un sistema econòmic, ràpid, segur i eficient per a avaluar tot tipus de compostos antivirals i anticossos que bloquegen l'entrada del virus SARS-CoV-2 en les cèl·lules humanes. La utilització de virus recombinants ha sigut emprada amb èxit en el garbellat de fàrmacs enfront de diferents virus d'importància mèdica, així com en el garbellat serològic. Els avantatges de la proposta estan ben fonamentades, destacant que aquesta tecnologia pot ser aplicable en el futur a altres virus que constituïsquen un problema de salut pública emergent.

L'habilitat de resoldre estructures poblacionals en alta resolució i profunditat és essencial per a comprendre l'evolució viral i la patogènesi. En aquest projecte implementem tècniques de seqüenciació basades en una extrema fidelitat cap a l'última generació per a poder abordar les qüestions clau de l'evolució viral i la patogènesi.

El projecte MicroHNSCC té com a objectiu identificar un patró específic de microbiota amb capacitat pronòstica i avaluar si eixe patró modula la resposta a tractament quimioradioteràpic de tumors avançats de cap i coll a través de la seua interacció amb el metabolisme tumoral.

Estem interessats a estudiar la simbiosi mutualista entre bacteris i hostatgers eucariotes, un fenomen molt estés en la naturalesa. Aquest és el cas de la endosimbiosi, que normalment implica relacions directes entre un bacteri intracel·lular i el seu hostatger; però també podem trobar ectosimbiosi, en aquest cas les relacions són entre un gran nombre d'espècies de bacteris i diferents òrgans d'un mateix hostatger, constituint la seua microbiota.

El projecte proposa el desenvolupament de dos tipus d'eines per a estudiar les funcions genètiques dels afídids. D'altra banda, el projecte proposa una metodologia RNAi alternativa que consisteix a aportar afídids amb un subministrament continu de dsRNA requerit per a desencadenar el RNAi en introduir en ell el virus d'una planta que infecte la planta de la qual el áfido s'alimenta de forma natural. Aquesta tècnica, cridada VIGS (Virus Induced Gene Silencing), és una eina que ha sigut utilitzada satisfactòriament per a detindre els gens de les plantes. En segon lloc, pretenem desenvolupar la metodologia CRISPR / Cas en afídids. A més d'investigar la utilització d'aquestes tècniques en els afídids, investigarem el paper dels gens candidats que hem identificat com a bons candidats per a controlar diversos polifenismes en afídids (incloent el polifenisme reproductiu).

Un enorme creixement de la investigació sobre la microbiota intestinal, sovint utilitzant models de rosegadors, ha demostrat àmpliament l'enorme importància dels microorganismes prèviament abandonats per a la nostra salut. No obstant això, la complexitat del sistema planteja un desafiament formidable.

El projecte STOP té com objetiu expandir i consolidar la base d'evidència multidisciplinària sobre la qual es poden construir polítiques efectives i sostenibles per a previndre i controlar l'obesitat infantil. STOP també té com a objectiu crear les condicions perquè l'evidència es traduïsca en política i perquè la política es traduïsca en impactes.

El projecte pretén identificar i caracteritzar els elements clau que regulen la manera de reproducció dels afídids. Ens interessa en particular dilucidar les bases moleculars responsables del canvi de la partenogènesi a la reproducció sexual i analitzar quin paper (si n'hi ha) juguen en aquest procedisc els gens del rellotge circadià.

El projecte té com a objectiu, mitjançant un enfocament multidisciplinari i interinstitucional, fer front a la problemàtica que representen les malalties transmeses per dos complexos ambrosials (X. glabratus – R. lauricola i Euwallacea sp. – F. euwallaceae). Aquestes plagues es componen d'un escarabat escolítino que exerceix com a vector i transmet un o diversos fongs patògens que infecten a la planta hoste causant-li ràpidament el pansiment progressiu i finalment la seua mort.

L'objectiu del projecte és trobar els principals gens de l'hoste involucrats en la simbiosi, homeòstasi i dinàmica del endosimbiont, així com desxifrar els seus mecanismes de regulació i funció en el corc de l'arròs Sitophilus oryzae. En combinar eines "in silico" i de laboratori esperem proporcionar una imatge clara dels gens implicats i la seua regulació, tant en l'homeòstasi de la endosimbiosi com en la dinàmica dels endosimbionts. Volem proporcionar les bases per a identificar molècules específiques que pertorben la relació endosimbiòtica, com una nova estratègia de control tant per als corcs com per a altres plagues d'insectes.

El programa InGEMICS-CM (Enginyeria Microbiana, Salut i Qualitat de Vida-CM) té com a objectiu col·locar a la Comunitat de Madrid com una referència tecnològica i científica en Microbiologia Quantitativa i Medicina de Precisió usant les tecnologies òmiques i d'imatge més innovadores juntament amb eines noves i poderoses per a l'anàlisi de dades i el modelatge matemàtic i simulació. Aquest innovador desenvolupament tecnològic ens permetrà abordar alguns dels desafiaments actuals en Biomedicina: (1) el problema de controlar la resistència a antibiòtics; (2) la comprensió de la rellevància del Microbioma en la Salut Humana i la Fisiopatologia; (3) la cerca de noves activitats i funcions biològiques per al desenvolupament farmacèutic i biotecnològic i (4) el desenvolupament de medicina de precisió amb impacte clínic, social i econòmic.

L'objectiu principal és aprendre el paper que exerceix la comunicació de la ciència en l'origen de les creences, percepcions i coneixements relatius a les qüestions científiques. Per aconseguir aquest objectiu, durem a terme cinc consultes ciutadanes a Lisboa (Portugal), València (Espanya), Vicenza (Itàlia), Trnava (Eslovàquia) i Lodz (Polònia), amb la participació d'un total de 500 ciutadans sobre quatre temes científics "candents": vacunes, ús de medicines complementàries i alternatives, canvi climàtic, seguretat alimentària. L'objectiu dels investigadors és aprofundir en la comprensió de la ciència per part del públic i identificar els models actuals de comunicació científica.

La síndrome de Lynch (LS) és una afecció hereditària que implica un alt risc de càncer colorectal (CCR), càncer d'endometri i altres tumors. Presenta una herència dominant autosòmica i és causada per mutacions de la línia germinal en gens involucrats en el mecanisme de reparació d'errors que funciona durant la replicació del DNA [mismatch repair gens (MMR)].*LS té una penetrancia incompleta i una expressió variable. S'han descrit diferències significatives en el fenotip clínic dels pacients amb LS depenent del gen MMR que estiga mutat. Hi ha una gran heterogeneïtat en el risc de càncer en portadors de mutacions. Les causes d'aquesta heterogeneïtat són desconegudes, però poden deure's a gens modificadors de la penetrancia, canvis epigenètics i/o factors ambientals. Recentment, s'ha observat evidència d'un efecte beneficiós en ratolins model deficients en MMR i genèticament predisposats a CCR després de reduir si microbiota intestinal mitjançant el tractament amb antibiòtics i/o amb una dieta baixa en carbohidrats. Els derivats del metabolisme de carbohidrats, com el butirat generat per espècies del tall Firmicutes, són en última instància responsables del CCR en ratolins amb mutacions en MSH2. Aparentment, les alteracions específiques en la comunitat microbiana colorectal dels tractaments mencionats anteriorment resulten en una producció insuficient de metabòlits involucrats en les vies que contribueixen a la protecció contra la progressió del CCR. En aquesta proposta avaluarem l'impacte funcional de la microbiota en el desenvolupament de la oncogènesis colorectal en una cohort d'individus sans amb alt risc genètic de CCR.

La simbiosi mutualista és un fenomen molt estés en la naturalesa. Existeixen dos sistemes simbiòtics en insectes: la endosimbiosi, en el qual bacteris mutualistes intracel·lulars juguen un paper nutricional essencial, i la ectosimbiosi, en la qual estan implicades principalment bacteris intestinals i, la funció dels quals encara no es coneix. Les paneroles són especialment interessants perquè els dos sistemes simbiòtics coexisteixen en el mateix individu.

El concepte de microbiota estable implica la idea que, després d'una pertorbació, la comunitat microbiana torna a la seua posició inicial en termes de composició (resiliència) o funció (redundància funcional) quan desapareix el factor pertorbador. Mitjançant l'aplicació d'un Nou mètode desenvolupat en el nostre grup, el programari Complex Cruncher, i mitjançant la determinació de la composició (metagenoma) i la funció (metatranscriptoma i metaboloma) de la microbiota intestinal, podem avaluar la seua estabilitat en un estudi longitudinal. Per a això, van participar voluntaris de la Comunitat Valenciana en aquest estudi, concretament 10 bebés, 10 adults i 10 ancians no relacionats i, d'altra banda, una cohort de 12 xiquets xicotets, 13 adolescents i 35 adults relacionats. Per cadascun dels voluntaris es va recol·lectar entre 8 i 10 mostres fecals i tots els procediments van ser revisats i aprovats per FISABIO.

Bacteris simbiòtics mutualistes, ja siguen intracel·lulars (endosimbionts) o comunitats de exosimbionts complexos localitzats en òrgans (com els intestins) dels hostes eucariotes poden ser explotades per a afectar els seus hostes per la modificació o la millora artificial de noves capacitats. Obtindre models experimentals robustos és de gran importància per a aconseguir un major coneixement d'aquests sistemes abans de manipular-los. En aquest projecte treballarem amb els endosimbionts Blattabacterium i exosimbionts del sistema digestiu de les paneroles Blattella germanica i les espècies seleccionades de Lepidòptera.

La investigació del nostre grup se centra en microorganismes d'interés en salut humana, amb la finalitat de proposar a l'administració sanitària pautes d'actuació en relació a determinats patògens, malalties relacionades amb l'alteració de les microbiotas i brots epidèmics.

El reciclatge de productes plàstics multimaterial, és a dir, compostos per diferents materials plàstics, és clau per a poder complir els objectius de reciclatge per a 2031 marcats per la Comissió Europea, que estableixen que més del 50% dels residus plàstics generats a Europa hauran de reciclar-se, fet que esta molt per sobre del 32.5% aconseguit en 2018.

Aquest projecte contribuirà a la identificació del mecanisme molecular d'acció de microorganismes probiòtics, basat en la identificació de les vies de síntesi de determinants moleculars de la seua acció. Es proposa un doble enfocament: computacional i experimental. Així, s'elaborarà una sèrie de models metabòlics a escala genòmica (GEM) a partir de les seqüències anotades de genomes de bifidobacteris.

MIPLACE té com a objectiu introduir en l’economia circular els polímers plàstics de tereftalat de polietilè (PET) i poliuretà (PU), que constitueixen una gran part de les deixalles plàstiques que produïm. Se centra en la possibilitat d’emprar microorganismes o parts d'ells que utilitzen aquests plàstics i els transformen en altres molècules de Bio-PU, que són industrialment rellevants i més sostenibles. D’altra banda i acomplint amb el marc de l’economia circular, no només es treballa en la seua fabricació, sinó que també en el reciclatge d’aquests productes Bio-PU per completar la producció sostenible d’aquest important material.

L'objectiu central de SETH és la generació d'una base de coneixement, un conjunt de soques útils i una diversitat de tecnologies genètiques combinades per permetre un nou tipus de processos industrials i ambientals a gran escala mediats per cèl·lules bacterianes però executats sota condicions de (molt) baixa activitat d’aigua. Aquest esforç es basa en l’èxit del projecte precedent HELIOS, però va molt més enllà aprofitant la riquesa d’activitats biològiques que es troben en els bacteris tolerants a la dessecació i la seua reconstrucció per al disseny de biocatalitzadors capaços de treballar sota una varietat de configuracions fisicoquímiques sense precedents.

L'objectiu principal és intercanviar informació i coneixements entre els països afectats per malalties causades per Xylella fastidiosa per reunir totes les dades disponibles sobre el bacteri, els seus vectors, la situació dels cultius afectats en els països iberoamericans i les activitats de prevenció i control que s’estan duent a terme. Amb això es pretén generar coneixement per contribuir al desenvolupament d’un sistema d'alerta i vigilància tecnològica que permeta als governs locals o nacionals prendre les mesures necessàries per seguir, contenir i eradicar la malaltia.

L'objectiu principal d'aquest projecte és aprofundir en la comprensió de les bases microbianes de l'endometriosi, analitzant els canvis i la relació entre el microbioma endometrial i el digestiu i determinant si les alteracions en la microbiota del tracte reproductiu i/o digestiu poden ser causants de l'endometriosi. Es pretén també avaluar l'efecte de bacteris probiòtics en models d'infecció endometrial com a possible tractament d'aquesta malaltia.

L'objectiu principal és aprendre el paper que exerceix la comunicació de la ciència en l'origen de les creences, percepcions i coneixements relatius a les qüestions científiques. Per aconseguir aquest objectiu, durem a terme cinc consultes ciutadanes a Lisboa (Portugal), València (Espanya), Vicenza (Itàlia), Trnava (Eslovàquia) i Lodz (Polònia), amb la participació d'un total de 500 ciutadans sobre quatre temes científics "candents": vacunes, ús de medicines complementàries i alternatives, canvi climàtic, seguretat alimentària. L'objectiu dels investigadors és aprofundir en la comprensió de la ciència per part del públic i identificar els models actuals de comunicació científica.

Proposem reunir les parts interessades més rellevants de tots els aspectes de la estandardització en biologia a Europa en un escenari de co-creació; posar a prova empíricament les pràctiques culturals de normalització (centrades en el laboratori) i promoure una redefinició conceptual i tècnica consensuada dels estàndards biològics; i, finalment, fomentar una caixa d'eines realista i flexible de parts biològiques estàndard, incloent un conjunt reduït de xassís especialitzats per a aplicacions específiques, així com un marc conceptual renovat per informar els responsables de l'elaboració de les polítiques, als científics ia altres actors socials.

El projecte s'emmarca en la línia d'investigació continuada del grup que pretén aportar bases de coneixement i també estratègies tecnològiques derivades per a la millora de l'eficiència dels llevats vínics en tots els processos industrials en els quals participen: producció de biomassa de llevat sec actiu i fermentació vínica. Els objectius específics d'aquest projecte estan orientats a l'estudi de la integració de les diferents rutes de senyalització per nutrients i dels mecanismes d'adaptació a estrés oxidatiu en condicions industrials, i a la caracterització de l'adequació i millora tecnològiques de llevats no convencionals d'interés en enologia.

L'objectiu general és augmentar el coneixement sobre les comunitats bacterianes que viuen en superfícies artificials (plaques solars) en condicions extremes, de tal manera que puguem entendre els mecanismes moleculars que fan possible la seua supervivència i aplicar aquests coneixements per desenvolupar aplicacions biotecnològiques.

El principal objectiu és la identificació de microorganismes d'interès biotecnològic en una biocenosi totalment inexplorada: la superfície de les plaques solars. S'establirà una col·lecció de bacteris cultivables i pigmentats. Es procedirà a un cribratge de la seua activitat antioxidant en l'organisme model Caenorhabditis elegans i a una avaluació del seu contingut en carotenoides mitjançant HPLC.

Aplicació d'enfocaments globals i multidisciplinaris de la Biologia de Sistemes per a la generació de solucions biotecnològiques innovadores a reptes socials i empresarials.