Diseño del laboratorio de microbiología clínica
ASIGNATURA 1. DISEÑO DEL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA CLINICA
(Juan José Camarena)
1.1.-El ¿laboratorio¿ del Servicio de Microbiología Clínica como herramienta de diagnóstico de las enfermedades infecciosas: Recomendaciones generales; Peculiaridades y necesidades específicas; Nuevas tecnologías; Atención continuada; Introducción a los modelos actuales de diseño y gestión.
1.2.- Aspectos estructurales: Espacios; Señalización; Materiales e instalaciones; Normativa al respecto; Estructura y flujos de trabajo según modelo de laboratorio.
1.3.- Áreas y/o Departamentos específicos: Administración; Toma de muestras; Recepción y siembra; Áreas de trabajo específicas; Área de cocina y esterilización: Área de almacenamiento.
1.4.- Modernización de laboratorios en áreas específicas: Automatización e integración del laboratorio de Microbiología: Laboratorios de Seguridad; El laboratorio de microbiología molecular.
1.5.- Implementación de los laboratorios ¿Point-of-Care¿ (POC) en Microbiología Clínica: POC Test y diagnóstico sindrómico: Instrumentos, localización y espacios.
1.6.- Modelos de laboratorios de Microbiología Clínica actual: Servicios de Microbiología ¿autónomos¿ vs. Unidades de Microbiología; El modelo integrado en Centros de Diagnóstico Biomédico. Laboratorios ¿core¿: aportaciones y desventajas para la microbiología clínica. Estrategias de diferenciación.
1.7.- Aspectos de diseño asociados a Bioseguridad en el laboratorio: Normas específicas en las distintas áreas de trabajo; Evaluación de riesgo físico, químico y/o biológico. Gestión de residuos.
Técnicas diagnósticas
(Germán Bou Arevalo)

Jefe de servicio de Microbiología
Complejo Universitario de la Coruña

2.1.-Métodos fenotípicos: microscopía, características macroscópicas, cultivos, pruebas bioquímicas, resistencia a compuestos, sistemas manuales, automatizados etc
2.2-Métodos moleculares:
2.2.1- Diana específica: ARN 16S, rpoB, gyrB, otras dianas especie-específicas etc
2.2.2-Pruebas/paneles sindrómicos: metodología, aspectos diferenciales, pros/cons..
2.2.3-Next Generation Sequencing (NGS) aplicada al diagnóstico
3.-Métodos proteómicos. Sistemas comerciales disponibles, y aspectos diferenciales entre ellos. Pros/cons
4.- Métodos serológicos y/o detección de antígenos
5.-Métodos Point-of-Care
6.-Nanotecnología diagnóstica en microbiología
6- Otros: detección compuestos volátiles, fluorescencia¿.
Evaluación de la sensibilidad a antimicrobianos y detección de resistencia microbiana
Rafael Cantón
Jefe de servicio de Microbología
Hospital Universitario Ramón y Cajal

3.1.- Concepto de sensibilidad y de resistencia. Resistencia intrínseca y adquirida.
3.2.- Métodos de estudio de sensibilidad a los antimicrobianos. Comités de interpretación del antibiograma y puntos de corte. Interpretación y lectura interpretada del antibiograma.
3.3. Estudio de combinaciones de antimicrobianos.
3.4. Estudio de sensibilidad en bacterias en crecimiento en biopelículas
3.5. Nuevos métodos en el estudio de sensibilidad a los antimicrobianos, incluyendo métodos rápidos
3.6. Detección de mecanismos de resistencia (métodos moleculares, espectrometría de masa, inmunocromatografía, ¿).
3.7. Detección de pacientes colonizados o infectados por microorganismos multirresistentes. Cultivos de vigilancia epidemiológico y métodos moleculares.
3.8. Métodos de estudio de tipificación de microorganismos. Estudio de brotes en el laboratorio de Microbiología. Análisis bioinformático.
Investigación del microbioma en el diagnóstico de las enfermedades infecciosas
Jordi Vila
Address:Department of Microbiology
University of Barcelona
School of Medicine

Current position:

- Full Professor, Department of Microbiology, School of Medicine, University of Barcelona.
- Head of the Department of Clinical Microbiology, Hospital Clinic, Barcelona, Spain.
- Research Professor in the Institut of Global Health of Barcelona (ISGlobal).

4.1 Microbioma: Concepto y evolución. Impacto en la salud
4.2. Metodología para la caracterización
4.3. del microbioma ¿ Secuenciación genómica
4.4. Bioinformática aplicada al análisis del microbioma
4.5. Microbioma intestinal
4.6. Microbioma vaginal y uretral
4.7. Microbioma del árbol respiratorio
4.8. Microbioma de la piel
4.9. Microbioma y resistoma
4.10. Microbioma intestinal y sepsis
4.11 Aplicaciones actuales y futuras del análisis del microbioma como diagnóstico microbiológico
4.12 ¿Qué información clínica nos puede dar el microbioma?
4.13 Microbioma NO bacteriano
Control de calidad en el laboratorio de microbiología clínica
Concepción Gimeno
5.1.- Concepto de calidad. Sistemas de gestión de la calidad.: EFQM, ISO
5.2.- Certificación y acreditación. Normas ISO. Generalidades, semejanzas y diferencias. Consideraciones prácticas
5.3.- Calidad en las fases preanalítica, analítica y postanalítica
5.4.- Control de calidad: Control interno y externo. Características generales y definiciones
5.5.- Control de calidad interno. Material y cepas de referencia. Tendencias.
5.6.- Control de calidad externo. Programas de control de calidad.
5.7.- Programa SEIMC de control de calidad en Microbiología
5.8.- Verificación y validación de métodos. Documentos de un sistema de control de la calidad
5.9.- Control de reactivos y equipos Personal y formación
5.10.- Casos prácticos. Guía para la redacción de un Manual de la Calidad y Procedimientos Generales.
Evaluación analítica y económica de técnicas diagnósticas
6.1 Cómo evaluar una prueba diagnóstica en Microbiología: parámetros analíticos y ¿utilidad¿ clínica
6.2 Conceptos básicos en la evaluación económica de tecnología sanitaria (ETS): Metodología, fuente de datos de eficacia/efectividad, descripción y asignación de costes
6.3. Conceptos básicos en la evaluación económica de tecnología sanitaria (ETS): Medida de los resultados en salud, horizonte temporal, tasa de descuento, presentación y análisis de los resultados, plano de coste-efectividad, análisis de sensibilidad.
6.4. Construcción de modelos en estudios de ETS: modelos basados en árboles de decisión y modelos de estados de transición.
6.5. Estudios de evaluación económica de métodos de diagnóstico microbiológico: tecnología MALDI-TOF (matrix-assisted laser desorption ionization¿time of flight mass spectrometry) en el laboratorio de Microbiología.
6.6. Estudios de evaluación económica del uso de pruebas microbiológicas en el lugar de atención: técnicas POC (point of care)
Optimación de algoritmos diagnósticos en el manejo de síndromes infecciosos
Luis Martínez Martínez
Profesor titular Universidad de Córdoba
Facultad de medicina. Microbiología

7.1 Concepto y aplicación de ¿Diagnostic stewardship¿ en Microbiología Clínica
7.2 ¿Diagnostic stewardship¿ en el marco de los Programas de optimación del uso de antimicrobianos (PROA)
7.3. Diagnostic stewardship en infecciones sistémicas (Bacteriemia/sepsis)
7.4. Diagnostic stewardship en infecciones del Sistema Nervioso Central
7.5. Diagnostic stewardship en infecciones gastro-intestinales
7.6. Diagnostic stewardship en infecciones del tracto respiratorio
7.7. Diagnostic stewardship en infecciones de Transmisión Sexual (ITS)
7.8. Diagnostic stewardship en infecciones Congénitas
7.9. Diagnostic stewardship en infecciones por virus hepatotropos
Trabajo final de Máster
ASSIGNATURA 8. TREBALL DE FI DE MÀSTER
1.- Bases de la investigació mèdica
El mètode científic i la investigació biomèdica
Context actual de la investigació biomèdica en España
Fuentes de finançament de la investigació
Fuentes d'informació per a la investigació biomèdica
Anàlisi estadística bàsica en la investigació boimédica
2.- Metodologia en la investigació clínic-epidemiològica
Estudis observacionals de cohorts i casos- control
Estudis d'intervenció: l'assaig clínic
Aspectes metodològics de l'assaig clínic
Aspectes ètics i legals de l'assaig clínic
Elaboració i execució d'un protocol d'assaig clínic
Avaluació i interpretació dels resultats d'un assaig clínic
3.- Elaboració d'un projecte d'investigació
Hipòtesi i objectius
Disseny i estructura
Execució, seguiment i anàlisi de resultats
4.- Investigació biomèdica bàsica
Metodologia de la investigació bàsica
Tecnologia de laboratori en la investigació bàsica
Models experimentals animals
5.- Estudis d'utilització d'antimicrobians