En la Universitat de València, l'Escola de Doctorat amb la finalitat de garantir l'eficàcia, eficiència i qualitat dels processos d'ensenyament precisa d'estructures organitzatives. L'organigrama que es proposa per a aquesta finalitat és el següent:
Cada titulació comptarà amb el seu respectiu Comité de Qualitat del Programa de Doctorat.