El programa de doctorat s'estructura a través de dues línies d’investigació:
- Investigació Interdisciplinària en gènere, subjectivitat i polítiques d'igualtat.
- Investigació Interdisciplinària en desigualtats socioeconòmiques i polítiques públiques amb perspectiva de gènere.
Les professores responsables de les línies d’investigació són:
- Mónica Bolufer Peruga
- Gabriela Moriana Mateo
Cada una d’aquestes línies està estretament vinculada amb un dels dos grups d’investigació de l’Institut Universitari d’Estudis de les Dones (IUED), reconeguts oficialment per la Universitat de València des de 2014.