En las colecciones de vertebrados continentales del Cenozoico se diferencian las referentes a macromamíferos, entre otros consistente en material procedente de afloramientos en una serie estratigráfica excepcional de edad mio-pliocena con sedimentos marinos y continentales. Y las referentes a micromamíferos entre los que destaca el conjunto de fósiles recuperados del yacimiento de Venta del Moro dada la extrema riqueza de este en restos fósiles, y por ser la localidad tipo de varias especies.
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