Software LC-MS:
- Analyst 1.5.1: per al control i adquisició de dades de l'equip.
- Formula Finder e Isotopic pattern: per a determinar la fórmula molecular d'un compost desconegut.
- Peak View: per a la identificació de compostos de forma ràpida i eficaç (llibreries pròpies: pesticides, antibiotics-anthelmintics, organofosforats, nitrosamines, perfluorats, esteroids...).
- MultiQuant: per a realitzar treballs a nivell de triple quadrupolo.
- Markerview: metabonòmica per a l'anàlisi de components principals i estudi estadístics de resultats en identificació de compostos i metabòlits.
- MetabolitePilot: per a la identificació de metabòlits.
- Sciex OS; quantificació MRM.
GC-MS:
- MassHunter.
- Espectroteca Wiley, lllibreries RTL (pesticides) y Nist.