Group

Reference of the Group:

GIUV2013-113

Description of research activity:

El grupo está formado por varios investigadores de los departamentos de Informática y Estadística e Inv. Operativa con una larga trayectoria de trabajo en común, junto con la incorporación de otras personas llegadas posteriormente al dpto. de informática y varias colaboradoras, también ligadas por investigación común previa, de la Universitat Jaume I de Castellón. El nexo común más general es la visión por computador y análisis de imagen, tanto 2D como recientemente 3D, con especial atención a la imagen médica y a la generada por procesos biológicos. El objetivo común es aportar experiencia, currículum y soluciones aplicables a problemas médicos o industriales relacionados con el análisis de imagen, análisis de formas, reconstrucción y modelización de estructuras anatómicas y recuperación de información en bases de datos de imágenes. Debido a la complejidad del software que se debe desarrollar es necesaria una visión formal que atienda a la modelización del software y la interacción de éste con el usuario. En concreto, la actividad investigadora desarrollada hasta ahora, y que a la que se pretende dar si cabe mayor cohesión, se organiza en las siguientes líneas: - Segmentación y...El grupo está formado por varios investigadores de los departamentos de Informática y Estadística e Inv. Operativa con una larga trayectoria de trabajo en común, junto con la incorporación de otras personas llegadas posteriormente al dpto. de informática y varias colaboradoras, también ligadas por investigación común previa, de la Universitat Jaume I de Castellón. El nexo común más general es la visión por computador y análisis de imagen, tanto 2D como recientemente 3D, con especial atención a la imagen médica y a la generada por procesos biológicos. El objetivo común es aportar experiencia, currículum y soluciones aplicables a problemas médicos o industriales relacionados con el análisis de imagen, análisis de formas, reconstrucción y modelización de estructuras anatómicas y recuperación de información en bases de datos de imágenes. Debido a la complejidad del software que se debe desarrollar es necesaria una visión formal que atienda a la modelización del software y la interacción de éste con el usuario. En concreto, la actividad investigadora desarrollada hasta ahora, y que a la que se pretende dar si cabe mayor cohesión, se organiza en las siguientes líneas: - Segmentación y coregistro de estructuras anatómicas, en particular a partir de imágenes de radiología, imágenes de resonancia magnética, imágenes de tomografía de emisión de positrones (PET) u otras modalidades, si el caso lo requiere. El análisis estadístico de las formas obtenidas para su comparación, indexado o modelización requiere el uso de técnicas de morfometría que conectan esta línea con la siguiente. - Morfometría, entendida como análisis estadístico de formas, tanto 2D como 3D, para determinar sus variaciones temporales o entre grupos de casos y la obtención de prototipos representativos de clases de formas. - Fisiología Computacional, entendida como la modelización multi-escala de procesos biológicos y médicos por medio de herramientas ICT para entender mejor la pato-fisiología y mejorar el diagnóstico y tratamiento de las enfermedades. La modelización a mayor escala (órganos) conecta esta línea con la anterior, en tanto que el análisis de formas se aplique a órganos como el hígado o el corazón; la modelización a menor escala lo conecta con la línea siguiente, - Modelos estocásticos espacio-temporales para el análisis de procesos dinámicos a partir de secuencias de imágenes. En concreto, se aplican metodologías estadísticas basadas en procesos germen-grano univariantes y bivariantes que se han empleado hasta el momento para modelizar procesos en biología celular analizando imágenes generadas por microscopio confocal. - Recuperación de imágenes y formas basada en el contenido visual en grandes bases de datos de imágenes o formas, en general, no etiquetadas manualmente con texto descriptivo, con especial atención a bases de datos de morfometría humana y bases de datos de imágenes médicas. Esto apoya la organización y descripción semántica de los casos de estudio usados en líneas anteriores. - Métodos de producción de software y modelado de la interacción de éste con el usuario. Esta línea transversal analiza y ordena el software producido (de hecho, el principal resultado aplicable de nuestra investigación) de modo que sea correcto, reusable, extensible y fácilmente manejable (en el caso de productos finales) por usuarios competentes en el contenido, pero no especializados en computación, en particular médicos o personal sanitario. La aplicabilidad de esta investigación se centra en el área biomédica, y tiene su fin último en la aplicación clínica, pero existen derivaciones interesantes en campos como la investigación básica en campos como la biología celular, o la ciencia de materiales y otras utilidades prácticas más directas como el diseño de redes de comunicación y redes de sensores, el diseño de ropa, los sistemas de recomendación de compras usando el aspecto visual de los objetos, etc.
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Web:

No indicada

Scientific-technical goals:

Análisis de imágenes 2D y 3D. Extracción de características relevantes. Modelización de procesos biológicos. Ayuda al diagnóstico médico

Research lines:

Antropometria i disseny de roba. Application of statistical techniques to shape modelling with special attention to apparel design and human organ modelling. We use mean and confidence sets to describe the 3D shapes; also, clustering techniques are used to provide alternative sizing systems and more reliable anatomical models.
Computational Physiology. Modeling of multi-scale biological and medical processes from microscopy and medical imaging data by means of ICT tools to increase the understanding of the patho-physiology and improve the diagnosis and treatment of diseases.
Software development methods and interaction modelling and usability. Definición de métodos de producción de software basados en el paradigma de desarrollo software dirigido por modelos, el cual parte de un conjunto de modelos conceptuales que representan un sistema de forma abstracta a los que se les aplican reglas de transformación para generar código automáticamente.
Segmentation and registration of anatomical structures. Multiple sources of medical images are routinely used in clinical practise (MRI, TAC, PET, ECO...) Methods are needed to isolate the organs, analyse their deviation from normality and matching them with other cases or with explorations of the same patient to help doctors in the diagnosis of diseases.
Visual Information Retrieval in image databases. The purpose of a content based image retrieval system is to retrieve all the images relevant to a user query. Our main goals are the study of new low level descriptors and relevant feedback procedures that are able to deal with the semantic gap, currently using also fusion with textual information.
Models estocasticos espai-temporals per a l’anàlisi de processos dinàmics a partir de seqüències d'imatges. We model dynamic processes using spatial point processes and random closed sets. Descriptors for univariate and bivariate processes with an explicit statistical analysis of the time and tests for hypothesis testing are proposed. Software for simulation and analysis is developed. More info and applications to cell biology in http://www.uv.es/tracs

Group members:

Name	Nature of participation	Entity	Description
Juan de Mata Domingo Esteve	Director-a	UVEG-Valencia	Catedràtic-a d'Universitat
Equip d'investigació
Guillermo Ayala Gallego	Membre	UVEG-Valencia	Catedràtic-a d'Universitat
María Roser Benavent Garcia	Membre	UVEG-Valencia	Titular d'Universitat
María Elena Díaz Fernández	Membre	UVEG-Valencia	Titular d'Universitat
Esther Dura Martínez	Membre	UVEG-Valencia	Professor-a Contractat-da Doctor-a
María Teresa León Mendoza	Membre	UVEG-Valencia	Titular d'Universitat
Esther de Ves Cuenca	Membre	UVEG-Valencia	Titular d'Universitat
Irene Epifanio López	Col·laborador-a	UJI-Castellón	Professor-a Titular d'Universitat
María Victoria Ibáñez Gual	Col·laborador-a	UJI-Castellón	Professor-a Titular d'Universitat
Amelia Simó Vidal	Col·laborador-a	UJI-Castellón	Professor-a Titular d'Universitat

Grup

Engineering and architecture

Image Analysis, Modelling and Retrieval - IARM