El IUED i els seus integrants han vist reconeguda la seua trajectòria amb diversos premis:

• Premi Isabel de Villena (Ajuntament de Quart de Poblet, IV edició): 12 de març de 2010.
• Premi a la Dona (Corts Valencianes): 7 de març de 2006.
• Premi de la Associació Dons Progressistes de la Comunitat Valenciana: març de 2002.
• Premi FECYT a la Promoció a la Igualtat en el Coneixement, concedit a la Professora Isabel Morant Deusa (octubre de 2007).

A proposta del IUED en 2009, la Universitat de València va concedir el doctorat honoris causa a la professora Seyla Benhabib, catedràtica de Filosofia i Ciències Polítiques de la Universitat de Yale, en 2010.