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Regulación Transcripcional del Metabolismo Secundario de Plantas - TOMSlab

Referencia del grupo:

GIUV2019-467

 
Descripción de la actividad investigadora:
Las plantas fabrican metabolitos especializados que ayudan en la interacción y supervivencia con su entorno. Estos compuestos, denominados "metabolitos secundarios", constituyen una rica fuente de beneficios para la salud en la nutrición humana, y también representan los componentes básicos en el desarrollo de nuevos productos farmacéuticos. Sin embargo, el metabolismo secundario se limita en ocurrencia, y algunos compuestos están restringidos temporal y espacialmente a ciertos grupos taxonómicos.El desarrollo y el metabolismo secundario son procesos estrechamente conectados. Parte de esta asociación depende de la expresión diferencial de genes: si bien la información se instruye y se cablea en el genoma, su regulación y visualización en ciertos tipos de células determinarán en última instancia la capacidad de acumular diferentes metabolitos.El control del metabolismo secundario en respuesta a las señales ambientales y de desarrollo es ejercido por factores de transcripción y correguladores transcripcionales que actúan sobre secuencias de ADN reguladoras cis que determinan cuándo, dónde y cómo se expresan los genes, pero también sobre otros tipos de proteínas reguladoras y ARN. En...Las plantas fabrican metabolitos especializados que ayudan en la interacción y supervivencia con su entorno. Estos compuestos, denominados "metabolitos secundarios", constituyen una rica fuente de beneficios para la salud en la nutrición humana, y también representan los componentes básicos en el desarrollo de nuevos productos farmacéuticos. Sin embargo, el metabolismo secundario se limita en ocurrencia, y algunos compuestos están restringidos temporal y espacialmente a ciertos grupos taxonómicos.El desarrollo y el metabolismo secundario son procesos estrechamente conectados. Parte de esta asociación depende de la expresión diferencial de genes: si bien la información se instruye y se cablea en el genoma, su regulación y visualización en ciertos tipos de células determinarán en última instancia la capacidad de acumular diferentes metabolitos.El control del metabolismo secundario en respuesta a las señales ambientales y de desarrollo es ejercido por factores de transcripción y correguladores transcripcionales que actúan sobre secuencias de ADN reguladoras cis que determinan cuándo, dónde y cómo se expresan los genes, pero también sobre otros tipos de proteínas reguladoras y ARN. En TOMSlab estamos interesados en la regulación transcripcional del metabolismo secundario. Esto ha incluido análisis genómicos de familias de factores de transcripción y análisis de expresión génica global, así como un interés en los enfoques de biología de sistemas que integran conjuntos de datos de transcriptómica y metabolómica.El enfoque actual del laboratorio es el estudio a nivel mundial de redes reguladoras de genes que controlan el metabolismo de fenilpropanoides e isoprenoides en frutos carnosos climatéricos y no climatéricos, como el tomate (Solanum lycopersicum) y la vid (Vitis vinifera), respectivamente. También estamos interesados en varias otras especies que poseen propiedades farmacéuticas potenciales que las hacen importantes para el descubrimiento de fármacos y la mejora de los alimentos funcionales.
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Página Web:
 
Objetivos cientificotécnicos:
  • Generación de datos ómicos en especies vegetales y cultivos celulares inducidos para la producción de metabolitos secundarios.
  • Desarrollo de algoritmos computacionales para la integración de datos multi-ómicos
  • Cultivo in vitro de especies comerciales de frutales o interés medicinal y desarrollo de plataformas de transformación genética.
  • Caracterización funcional de genes reguladores del metabolsimo especializado de plantas.
 
Líneas de investigación:
  • Genome-wide characterization of the R2R3-MYB transcription factor family in plants. Intentamos caracterizar a la familia MYB en diferentes especies de plantas combinando estudios de todo el genoma y en caracterizaciones funcionales de planta.
  • Enfoques integrales ómnicos para identificar nuevos reguladores y pasos enzimáticos desconocidos de vías metabólicas secundarias. Asociamos datos transcriptómicos y metabólicos en órganos de plantas o cultivos celulares para aislar enzimas metabólicas secundarias desconocidas y sus reguladores transcripcionales.
  • Análisis de todo el genoma de las respuestas de la vid a las tensiones ambientales, incluidas las influenciadas por el cambio climático.. Estamos interesados en abordar diferentes datos bioinformáticos acoplados a datos experimentales para modelar las respuestas al estrés de las plantas, utilizando la vid como modelo de frutos carnosos no climatéricos.
 
Componentes del grupo:
Nombre Carácter de la participación Entidad Descripción
Jose Tomas Matus PiceroDirector-a UVEG-Valencia Investigador-a contractat-ada Ramón y Cajal
Equip d'investigació
Pablo Yussef Romero CortesMembre UVEG-Valencia Investigador-a no Doctor-a UVEG A1
Luis Orduña RubioCol·laborador-a UVEG-Valencia Investigador-a en Formació Predoctoral en el Ministeri
Chen ZhangCol·laborador-a UVEG-Valencia Estudiant-a de doctorat de la Universitat de València
Equip de Treball
Jone Echevarria AlberdiEquip de Treball UVEG-Valencia Tècnic-a Superior Suport Projecte Investigació
David Navarro PayáEquip de Treball UVEG-Valencia Estudiant-a de màster
Alberto Pérez TejedaEquip de Treball UVEG-Valencia Estudiant-a de màster
Antonio Santiago PajueloEquip de Treball UVEG-Valencia Estudiant-a de màster