Horizonte Europa incluye entre sus principales novedades la financiación de misiones de I+D+I, que se definen como proyectos de gran impacto y envergadura, centrados en resolver los grandes retos de la sociedad. La reglamentación de Horizonte Europa establece cinco áreas principales, donde se ha trabajado en la definición de misiones específicas. España defendió estas misiones de investigación en el transcurso de las negociaciones del programa marco europeo.