GIUV2014-187

Estudios de diversidad procariótica de medios acuáticos (en especial marinos) y de taxonomía bacteriana.- Caracterización polifásica de bacterias y arqueas, especialmente marinas, con fines taxonómicos, descripción formal y conservación de nuevos taxones bacterianos y generación de bases de datos de utilidad en su identificación.- Caracterización fenotípica y funcional: caracteres culturales, estructurales, fisiológicos, bioquímicos y nutricionales.- Genómica comparada aplicada a la taxonomía procariótica: obtención de datos (nuevas secuencias, ampliación y/o cerrado) de cepas tipo y nuevos aislamientos. - Estudios filogenéticos basados en genes conservados (gen 16S rRNA, diversos genes esenciales) o en genomas completos. - Determinación de valores de hibridación DNA-DNA in silico e índices ANI (Average Nucleotide Identity) y AAI (Average Aminoacid Identity) a partir de secuencias genómicas.- Aspectos formales: Nomenclatura en Taxonomía de procariotas. Grupos taxonómicos: preferentemente familias, géneros y especies de los filos Pseudomonadota (en especial familias Vibrionaceae, Halomonadaceae y Rhodobacteraceae) y Bacteroidota (orden Flavobacteriales), entre otros taxones.

https://www.uv.es/uvweb/departamento-microbiologia-ecologia/es/investigacion/grupos-investigacion/grupo-investigacion-diversidad-microbiana-taxogenomica-procariotas-/presentacion-1286272398742.html

• Caracterización genòmica de cepas de origen acuático, incluyendo sus posibles aplicaciones biotecnológicas.
• Generación de conocimiento en torno a la diversidad microbiana de ambientes acuáticos.
• Clasificación taxonómica de bacterias marinas heterótrofas.

• Taxonomy of marine bacteria . Clasificación, identificación y nomenclatura de bacterias marinas: caracterización polifásica (fenotípica, genómica y filogenética), especialmente de alfa/gammaproteobacterias y bacteroidetes mediante MLSA, hibridación DNA-DNA, índices taxogenómicos y fenotipado clásico.
• Genomics applied to the taxonomy of prokaryotes . Estudios de aplicación de la genómica comparada a la taxonomía procariota. Incluye tanto la obtención de datos (nuevas secuencias, ampliación y/o cerrado) de cepas tipo y cepas adicionales de interés para el grupo así como su posterior análisis con herramientas informáticas y secuencias públicas.