Regulació transcripcional del metabolisme secundari de plantes - TOMSlab

Referència del grup:

GIUV2019-467

 
Descripció de l'activitat investigadora:
Les plantes fabriquen metabòlits especialitzats que ajuden en la interacció i supervivència amb el seu entorn. Aquests compostos, denominats "metabòlits secundaris", constitueixen una rica font de beneficis per a la salut en la nutrició humana, i també representen els components bàsics en el desenvolupament de nous productes farmacèutics. No obstant això, el metabolisme secundari es limita en ocurrència, i alguns compostos estan restringits temporal i espacialment a uns certs grups taxonòmics. El desenvolupament i el metabolisme secundari són processos estretament connectats. Part d'aquesta associació depén de l'expressió diferencial de gens: si bé la informació s'instrueix i es cableja en el genoma, la seua regulació i visualització en uns certs tipus de cèl·lules determinaran en última instància la capacitat d'acumular diferents metabòlits. El control del metabolisme secundari en resposta als senyals ambientals i de desenvolupament és exercit per factors de transcripció i correguladors transcripcionals que actuen sobre seqüències d'ADN reguladores cis que determinen quan, on i com s'expressen els gens, però també sobre altres tipus de proteïnes reguladores i ARN. En TOMSlab...Les plantes fabriquen metabòlits especialitzats que ajuden en la interacció i supervivència amb el seu entorn. Aquests compostos, denominats "metabòlits secundaris", constitueixen una rica font de beneficis per a la salut en la nutrició humana, i també representen els components bàsics en el desenvolupament de nous productes farmacèutics. No obstant això, el metabolisme secundari es limita en ocurrència, i alguns compostos estan restringits temporal i espacialment a uns certs grups taxonòmics. El desenvolupament i el metabolisme secundari són processos estretament connectats. Part d'aquesta associació depén de l'expressió diferencial de gens: si bé la informació s'instrueix i es cableja en el genoma, la seua regulació i visualització en uns certs tipus de cèl·lules determinaran en última instància la capacitat d'acumular diferents metabòlits. El control del metabolisme secundari en resposta als senyals ambientals i de desenvolupament és exercit per factors de transcripció i correguladors transcripcionals que actuen sobre seqüències d'ADN reguladores cis que determinen quan, on i com s'expressen els gens, però també sobre altres tipus de proteïnes reguladores i ARN. En TOMSlab estem interessats en la regulació transcripcional del metabolisme secundari. Això ha inclòs anàlisis genòmiques de famílies de factors de transcripció i anàlisi d'expressió gènica global, així com un interés en els enfocaments de biologia de sistemes que integren conjunts de dades de transcriptòmica i metabolòmica. L'enfocament actual del laboratori és l'estudi a nivell mundial de xarxes reguladores de gens que controlen el metabolisme de fenilpropanoids i isoprens en fruits carnosos climatèrics i no climatèrics, com la tomaca (Solanum lycopersicum) i la vinya (Vitis vinifera), respectivament. També estem interessats en diverses altres espècies que posseeixen propietats farmacèutiques potencials que les fan importants per al descobriment de fàrmacs i la millora dels aliments funcionals.
[Llegir més][Ocultar]
 
Pàgina Web:
 
Objectius cientificotècnics:
  • Generacion de datos omicos en especies vegetales y cultivos celulares inducidos para la produccion de metabolitos secundarios.
  • Desarrollo de algoritmos computacionales para la integracion de datos multi-omicos
  • Cultivo in vitro de especies comerciales de frutales o interes medicinal y desarrollo de plataformas de transformacion genetica.
  • Caracterizacion funcional de genes reguladores del metabolsimo especializado de plantas.
 
Línies d'investigació:
  • Caracterització a tot el genoma de la família de factors de transcripció R2R3-MYB en plantes.Intentem caracteritzar la família MYB en diferents espècies de plantes combinant estudis de tot el genoma i en caracteritzacions funcionals de planta.
  • Enfocaments omics integradors per identificar reguladors nous i passos enzimàtics desconeguts de les vies metabòliques secundàries.Associem dades transcriptòmiques i metabòliques en òrgans de plantes o cultius cel·lulars per a aïllar enzims metabòlics secundaris desconeguts i els seus reguladors transcripcionals.
  • Anàlisis del genoma de les respostes de vinya a estrès ambiental, incloses les influenciades pel canvi climàtic.Estem interessats a abordar diferents dades bioinformàtiques acoblats a dades experimentals per a modelar les respostes a l'estrés de les plantes, per a la qual cosa utilitzarem la vinya com a model de fruits carnosos no climatèrics.
 
Components del grup:
Nom Caràcter de la participació Entitat Descripció
JOSE TOMAS MATUS PICERODirector-aUniversitat de ValènciaPersonal Investigador
Equip d'investigació
Chen ZhangCol·laborador-aUniversitat de València - Estudi Generalestudiant-a de doctorat UVEG
 
CNAE:
  • Investigación y desarrollo experimental en biotecnología.
 
Estructura associada:
  • Institut de Biologia Integrativa de Sistemes (I2SYSBIO)
 
Paraules clau:
  • R2R3-MYB, DAP-SEQ, Metabolismo Secundario
  • Fluxomica, Espectrometria de Masas, Transcriptomica, Integracion
  • Cambio climatico, Radiación UV