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Genómica Funcional de Levaduras - GFL

Referencia del grupo:

GIUV2013-162

 
Descripción de la actividad investigadora:
Nuestro interés fundamental es conocer cómo responden las células a las señales que reciben modificando su expresión génica. Nuestro objetivo es abordar los cambios en la expresión génica estudiando sus distintas etapas, desde la activación transcripcional de los genes hasta la formación de moléculas de RNA mensajero y su traducción, prestando atención no solo a los factores implicados y los mecanismos, sino también a la conexión o crosstalk que se establece entre ellos y hace que la expresión génica no sea un proceso lineal sino interconectado hacia adelante y hacia detrás, en el tiempo y espacio. Además, prestamos especial atención a algunos factores que parecen claves en el control de la expresión génica y que muchas veces actúan de forma multidisciplinar en varios procesos biológicos y distintos compartimentos celulares. Uno de esos factores es la proteína eIF5A, altamente conservada desde levaduras a humanos y esencial en las células eucariotas. eIF5A es un factor de elongación de la traducción necesario en la síntesis de proteínas que contienen motivos de amino ácidos con prolinas consecutivas o con combinaciones de prolinas, glicinas y amino ácidos cargados. Nuestro interés...Nuestro interés fundamental es conocer cómo responden las células a las señales que reciben modificando su expresión génica. Nuestro objetivo es abordar los cambios en la expresión génica estudiando sus distintas etapas, desde la activación transcripcional de los genes hasta la formación de moléculas de RNA mensajero y su traducción, prestando atención no solo a los factores implicados y los mecanismos, sino también a la conexión o crosstalk que se establece entre ellos y hace que la expresión génica no sea un proceso lineal sino interconectado hacia adelante y hacia detrás, en el tiempo y espacio. Además, prestamos especial atención a algunos factores que parecen claves en el control de la expresión génica y que muchas veces actúan de forma multidisciplinar en varios procesos biológicos y distintos compartimentos celulares. Uno de esos factores es la proteína eIF5A, altamente conservada desde levaduras a humanos y esencial en las células eucariotas. eIF5A es un factor de elongación de la traducción necesario en la síntesis de proteínas que contienen motivos de amino ácidos con prolinas consecutivas o con combinaciones de prolinas, glicinas y amino ácidos cargados. Nuestro interés es entender el mecanismo de regulación de la traducción por eIF5A, determinando cuáles son las proteínas cuya síntesis requiere de este factor y cómo, directamente o a través de sus dianas, eIF5A actúa en procesos patológicos como la fibrosis, el cáncer o durante el envejecimiento. En nuestro grupo utilizamos principalmente como organismo modelo la levadura Saccharomyces cerevisiae puesto que es el eucariota mejor conocido y modelo para la comprensión a nivel celular de procesos moleculares conservados evolutivamente. Además, comprobamos que las conclusiones de nuestra investigación se pueden generalizar a células de mamífero utilizando cultivos de células de ratón o humanas.
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Página Web:
 
Objetivos cientificotécnicos:
  • Objetivo 1: Generación de técnicas de escala genómica y su utilización en la investigación de las diversas etapas y procesos de la expresión génica
  • Objetivo 2: Estudio del control de la traducción por el factor, conservado evolutivamente, eIF5A y su función en patologías
 
Líneas de investigación:
  • Análisis genómico de la transcripción en levadura . La complejidad del fenómeno de la expresión génica se comprenderá mejor si se mejoran las técnicas para medir, al nivel genómico, la transcripción in vivo y se usan aproximaciones genéticas y genómicas para clarificar las conexiones funcionales que controlan la transcripción.
  • Estudio del control de la traducción por el factor, conservado evolutivamente, eIF5A y su función en patologías. eIF5A es un factor de elongación que se une a los ribosomas cuando éstos se atascan durante la síntesis de algunas proteínas que contienen motivos con prolinas, glicinas y amino ácidos cargados. Nuestro grupo ha determinado que eIF5A es necesario para la síntesis de forminas (de levadura, mosca y ratones), colágeno (de ratón y humanos) y proteínas humanas que tienen tendencia a la agregación en células envejecidas. Nuestro objetivo es determinar mecanísticamente la función de eIF5A, a través de la síntesis de sus proteínas diana, en patologías tales como la fibrosis, el cáncer o durante el envejecimiento. Comprender estos mecanismos ayudará al desarrollo de terapias específicas dirigidas a regular la función de eIF5A.
 
Componentes del grupo:
Nombre Carácter de la participación Entidad Descripción
José Enrique Pérez OrtínDirector-a UVEG-Valencia Catedràtic-a d'Universitat
Equip d'investigació
Elia Paula Alepuz MartínezMembre UVEG-Valencia Titular d'Universitat
Marina Barba AliagaMembre UVEG-Valencia Investigador-a en Formació Predoctoral FPU
José García MartínezMembre UVEG-Valencia Titular d'Universitat
Vicente Tordera DonderisMembre UVEG-Valencia Catedràtic-a d'Universitat