Este espacio contiene un conjunto de salas dedicadas al gobierno de la Universitat de València. Decoran sus paredes algunos retratos reales, que en su día presidieron el Paraninfo, y otras pinturas de gran valor. Aquí se encuentra también la Sala de Juntas, uno de los lugares más representativos del edificio. Es un salón amplio y alargado, de líneas neoclásicas, decorado con estucados marmóreos y abundantes elementos dorados al agua, que le prestan una atmósfera radiante. Sobre sus paredes se dispone la serie de retratos de los rectores que han ejercido el cargo desde 1845, cuando la Universidad pasa a depender del Estado por la Ley de Instrucción Pública de Pedro José Pidal, hasta la actualidad. Preside la sala el magnífico retrato del rector vitalicio Vicente Blasco García, pintado por Mariano Salvador Maella. A este rector se le debe, en gran medida, la modernización de los estudios universitarios en Valencia, a partir de su propuesta de un nuevo plan de estudios firmado en 1786. Le acompañan a cada lado respectivamente los retratos de Juan Peset Aleixandre, fusilado por su compromiso político en 1942, y de Francisco Moliner Nicolás, a cuya iniciativa se debe la fundación del sanatorio de Portaceli en 1899.