La Universitat de València aporta a Europeana Regia 92 manuscrits dels més valuosos que estan dipositats a la Biblioteca Històrica. Aquestes obres procedeixen dels béns patrimonials del Duc de Calàbria i que al any 1550 va donar al Monestir de Sant Miquel dels Reis. Al segle XIX amb la desamorització van pasar a formar part del patrimoni bibliogràfic de la Universitat.
- Ms. 26 Petrarca, Francesco, 1304-137 Francisci Petrarche poete laureati quorundam virorum illustrium ad inclitum dominum insignis glorie ducem Franciscum de Cararia breve compendium
- Ms. 44 Vincent, de Beauvais, ca. 1190-1264 Speculum Historiale. XI-XVI
- Ms. 47 Tomàs, d'Aquino, sant 1225?-1274, Quaestiones disputatae
- Ms. 49 Kilwardby, Robert, 1215?-1279 Tabula in librum Sancti Augustini De civitate Dei
- Ms. 50 Bradwardine, Thomas, 1290?-1349 Geometria magistri Thome Brdvardini
- Ms. 51 Sèneca, Luci Anneu, ca. 4 aC-65 dC Lucii Annei Senecae Tragediarum liber
- Ms. 52 Pontano, Giovanni Gioviano, 1426-1503 Ioviani Pontani De principe liber
- Ms. 53 Tomàs, d'Aquino, sant, 1225?-1274 Thome de Aquino commentum in Marci Evangelium
- Ms. 54 Columel·la, Luci Juni Lucii Iunii Moderati Columellae rei rusticae
- Ms. 55 Macrobi, Ambròs Teodosi Macrobii Theodosii Saturnaliorum ; Commentarii in Somnium Scipionis. Publii Cornelii Scipionis africani Somnium
- Ms. 56 Dionís d'Halicarnàs, 60-8 aC Dionysii Halicarnasei originum sive Antiquitatum romanarum
- Ms. 132 Paladini, Paolo. fl. 1495-1510 Pauli Paladini Pharii oratio
- Ms. 289 Ubertino, da Casale, 1259-ca. 1329 Arbor vite crucifixe Jhesu et dicitur oppus Ubertini de Casali
- Ms. 291 Boccaccio, Giovanni, 1313-1375 Genealogiae deorum gentilium
- Ms. 292 Quintilià, Marc Fabi, ca. 30-ca. 95 Marci Fabii Quintiliani De Institutione oratoria
- Ms. 375 Contrario, Andrea Andreae Contrarii epistola ad Ferdinandum Siciliae regem de Platonis philosophi genitura
- Ms. 378 Jeroni, sant, ca. 342-420 Epistole de santo Geronimo traducte di latino
- Ms. 379 Tucídides Thucydidis De bello Peloponnesiaco
- Ms. 380 Tomàs, d'Aquino, sant, 1225?-1274 Aurea expositio sancti Pauli apostoli ad Corinthios explanata per Thomam de Aquino
- Ms. 381 Vincent, de Beauvais, ca. 1190-1264 Speculum Historiale. XVII-XXI
- Ms. 382 Livi, Tit, 59 aC-17 dC Terza Deca di Tito Livio padovano della Seconda Guerra Punica
- Ms. 383 Livi, Tit, 59 aC-17 dC Prima Deca di Tito Livio Padovano
- Ms. 384 Livi, Tit, 59 aC-17 dC Titi Livii patavini De secundo Bello Punico
- Ms. 385 Livi, Tit, 59 aC-17 dC Titi Livii patavini Ab urbe condita
- Ms. 386 Livi, Tit, 59 aC-17 dC La quarta Deca di Tito Livio padovano della Guerra Macedonica
- Ms. 387 Guillaume, de Lorris, 1200?-1260? Rommant de la rose
- Ms. 388 Aristòtil, 384-322 aC Aristotelis philosophi Ethicorum
- Ms. 389 Gel·li, Aulus, ca. s. II Auli Gellii Noctium atticarum
- Ms. 390 Albert Magne, sant, 1193?-1280 Albertus Magnus De mirabili scientia Dei
- Ms. 391 Esglèsia Catòlica Vesperal
- Ms. 392 Tucídides Thucididis Historiarum liber a Laurentio Vallensi traductus
- Ms. 393 Vincent, de Beauvais, ca. 1190-1264 Speculum Historiale. XXVI-XXIX
- Ms. 394 Rossellus, Paulus Descendentia dominorum regum Sicilie
- Ms. 395 Tomàs, d'Aquino, sant, 1225?-1274 Prima pars secunde partis Summe Theologie beati Thome de Aquino
- Ms. 396 Cèsar, Gai Juli, 100-44 aC Caii Julii Cesaris De bello Gallico
- Ms. 398 Filelfo, Francesco, 1398-1481 Francisci Philelfi satyrarum hecatostichon
- Ms. 399 Albert Magne, sant, 1193?-1280 Alberti Magni De laudibus beate Mariae Virginis
- Ms. 408 Valla, Lorenzo, 1406-1457 Elegantiarum Laurentii Vallae
- Ms. 412 Nonius Marcellus Nonii Marcelli Compendiosa doctrina
- Ms. 413 Homer Homeri Ilias per Laurentium Vallensem in latinum sermonem traducta
- Ms. 445 Beccadelli, Antonio (1394-1471) Antonii Panormitae in Alfonsi regis Dicta aut facta memoratu digna
- Ms. 447 Elfiteo, Fabrizio, fl.1470-1477 Fabricii Elphithei Elegiarum libellus
- Ms. 506 Lucreci, 94-55 aC Titi Lucretii Cari De rerum natura
- Ms. 595 Palmieri, Matteo, 1405-1475 Matthei Palmerii florentini De temporibus
- Ms. 601 Frederic II, Emperador romano-germànic, 1194-1250 Federici secundi romanorum imperatoris Iherusalem et Scilie regis De avibus et aucupando
- Ms. 611 Jeroni, sant, ca.342-420 Hieronymi in Danielem ad Pammachium et Marcellam
- Ms. 612 Valeri Màxim Factorum et dictorum memorabilium
- Ms. 614 Soli, Gai Juli Caii Iulii Solini De situ orbis terrarum et de singulis mirabilibus que in mundo habentur
- Ms. 683 Jeroni, sant, ca.342-420 Beati Hyeronimi Epistolarum liber
- Ms. 685 Biondo Flavio, 1392-1463 Historiam Blondi forliviensis ab inclinatione Imperii romanorum
- Ms. 689 Bonincontro, Lorenzo, 1410-1491 Laurentii Bonincontrii De ortu Regum Neapolitanorum
- Ms. 691 Plini Segon, Gai, ca. 24-79 Plinius Secundus Vespasiano libros naturalis historiae
- Ms. 692 Quintilià, Marc Fabi, ca. 30-ca. 95 Marci Fabii Quintiliani De institutione oratoria
- Ms. 720 Barbaro, Francesco 1398-1454 Franciscus Barbarus De re uxoria
- Ms. 723 Onosander Onosander ad Quintum Verannium De optimo imperatore eiusque officio
- Ms. 726 Eiximenis, Francesc, ca. 1340-ca. 1409 Psalterium alias laudatorium compositum per Franciscum Eximini
- Ms. 727 Vitruvi Pol·lió, Marc De architectura
- Ms. 730 Historiam sancti Paridis frater Lancelotus Macedonius
- Ms. 731 Xenofont, 430-354 aC Xenophon de Cyripaedia per Poggium florentinum e graeco traducta
- Ms. 732 Joan Crisòstom, sant ca. 344-407 De incomprehensibili Dei natura beati Johannis Chrysostomi
- Ms. 733 Ciril, d'Alexandria, sant, 380-444 Cyrilli Alexandrini liber Thesaurus adversus hereticos a Georgio Trapesuntio traductus
- Ms. 735 Orationes habitæ coram Ferdinando rege
- Ms. 736 Benvenuto, de Imola, 1338?-1390 Romuleon de illustribus principibus
- Ms. 758 Isop Vita e favole di Esopo
- Ms. 761 Phalaris Epistole di Phalari
- Ms. 764 Tomàs, d'Aquino, sant, 1225?-1274 Brevis Compilatio theologie edita a fratre Thoma de Aquino
- Ms. 765 Corneli Nepos, ca. 100-ca. 25 aC Emilii Probi De excellentibus ducibus externarum gentium
- Ms. 766 Michele, da Pavia Michael Papiensis Pronosticon Ferdinandi de Aragonia ducis Calabrie
- Ms. 767 Phalaris Francisci Aretini in Phalaridis tyranni agrigentini Epistolas
- Ms. 768 Virgili Maró, Publi, 70-19 aC Publii Vergilii Maronis Opera
- Ms. 774 Brancati, Giovanni, fl. 1440-1481 Orationes
- Ms. 776 Tanaglia, Michelangelo, 1437-1512 Michelangelo Tanaglia De re agraria
- Ms. 781 Pontano, Giovanni Gioviano, 1426-1503 Ioviani Pontani De Principe
- Ms. 833 Pontano, Giovanni Gioviano, 1426-1503 Ioviani Pontani De obedientia
- Ms. 834 Ausoni, Dècim Magne Opuscula
- Ms. 835 Tinctoris, Johannes, 1435?-1511? Opus musices JoannisTinctoris
- Ms. 836 Josep Flavi, 38-100 Flavii Iosephi De bello Iudaico
- Ms. 837 Virgili Maró, Publi, 70-19 aC Publii Vergilii Maronis Opera
- Ms. 838 Petrus, de Ebolo Nomina et virtutes balneorum Putheoli et Baiarum
- Ms. 839 Guarino, Veronese 1374-1460 Guarini Veronense Gramatice regule
- Ms. 840 Tomàs, d'Aquino, sant, 1225?-1274 Beati Thomae de Aquino Ad regem Cypri de rege et regno
- Ms. 842 Paulí, de Nola, sant, ca. 355-431 Epistole sanctissimi Paulini episcopi nolani ad diversos
- Ms. 844 Lazzaroni, Pietro De quattuor virtutibus cardinalibus
- Ms. 845 Boccaccio, Giovanni, 1313-1375 Iohannis Boccacii de Certaldo De mulieribus claris
- Ms. 847 Tomàs, d'Aquino, sant, 1225?-1274 Beati Thomae Aquinatis De ente et essentia
- Ms. 848 Nicolaus, Specialis, fl. 1334 1342 De gestis siculorum sub Friderico rege
- Ms. 887 Esglèsia Catòlica Breviarium
- Ms. 890 Esglèsia Catòlica Breviarium
- Ms. 891 Virgili Maró, Publi, 70-19 aC Publii Vergilii Maronis Opera
- Ms. 892 Agustí, sant, bisbe d'Hipona, 354-430 Aurelii Agustini Hipponae episcopi super loannem librum
- Ms. 893 Jeroni, sant, ca. 342-420 Sancti Hieronymi ad Pammachium in duodecim prophetas
- Ms. 894 Sèneca, Luci Anneu, ca. 4 aC-65 dC Opera Senecae