La colección de incunables está compuesta por unos 350 volúmenes, impresos en su mayoría en Italia, aunque también hay una representación menor de Francia y Alemania. Se conservan alrededor de 55 ejemplares españoles, procedentes de nueve ciudades. Entre ellos destacan los 31 libros impresos en Valencia, casi todos en valenciano, lo que explica que muchos de ellos sean ejemplares únicos o rarísimos, ya que debieron hacerse tiradas muy cortas.

De la primera imprenta establecida en Valencia, la de Lambert Palmart, cabe destacar Obres e Trobes en lahors de la Verge Maria, 1474, ejemplar único en el mundo. Otros incunables de los que sólo existe nuestro ejemplar son, Homelia sobre lo psalm 'De profundis' de Fuster, impreso también por Lambert Palmart en 1490; Vida de la Verge María de Pérez, impreso en Valencia por Nicolau Spindeler en 1494, que también imprimió, en 1499, Omelia sobre lo psalm 'Miserere mei Deus' de Vinyoles, así como Ethica ad Nicomachum en 1479 en Barcelona. 

Ejemplar rarísimo y obra emblemática, salvada en el Quijote de la hoguera, es Tirant lo Blanch de Joanot Martorell, salido de las prensas de Nicolau Spindeler en 1490 y del que sólo se conocen tres en el mundo.

Además del catálogo manual existe otro impreso, redactado por Abelardo Palanca y Pilar Gómez, editado por la Universidad de Valencia en 1981.

En el siguiente enlace se puede acceder a los incunables de la Biblioteca Històrica introducidos en el catálogo Trobes: Incunables