Tant la LRJSP com la LCTI estableixen uns continguts per als convenis. Depenent de la mena d'activitat a desenvolupar, s'inclouran els següents:

• Subjectes que subscriuen el conveni, capacitat jurídica de les parts, i competència.

• L'expositiu, on s'expliquen les circumstàncies de l'activitat a desenvolupar, es justifica la seua necessitat i es detallen les fortaleses, capacitats i recursos amb què compta cada part. Ací ja trobem al·lusions a l'interés o fi comuna que persegueixen les parts amb la consecució de les activitats objecte del conveni.

• Objecte del conveni, i actuacions a realitzar per cada part per al seu compliment. 

• Compromisos i obligacions de les parts: detall dels mitjans materials i humans que les parts es comprometen a aportar, així com la seua valoració econòmica, si escau, amb la indicació que seran aportacions en espècie i no necessiten cap consignació pressupostària. 

• Si existeixen, obligacions i compromisos econòmics adquirits per cada part, indicant la seua distribució temporal per anualitats i la seua imputació concreta, d'acord amb el que es preveu en la legislació pressupostària, en aquest cas, de la Universitat de València.

• Quan corresponga, s'identifiquen els responsables científics per cada part, que actuaran d'interlocutors.

• En determinats convenis (desenvolupament de projectes d'I+D+i per exemple), és necessari incloure una clàusula de confidencialitat que afectarà a totes les parts signants.

• També és rellevant en determinats convenis incloure el règim de distribució i protecció dels drets i resultats de la investigació. D'una banda, s'ha de incloure una regulació de l'ús del coneixement previ durant el desenvolupament del projecte i després, si aquest coneixement fóra necessari de cara a l'explotació del resultat; s'ha de regular també a qui pertanyeran els resultats obtinguts, la possibilitat d'obtenció de resultats compartits i el seu accés durant el període d'execució del projecte i la seua posterior explotació. Per al cas de la Universitat, la transmissió dels drets sobre aquests resultats a un tercer s'haurà de realitzar amb una contraprestació que corresponga al seu valor de mercat.

• Mecanismes de seguiment, vigilància i control, solen ser les Comissions de Seguiment, encarregades de resoldre els problemes d'interpretació i compliment que puguen plantejar-se.

• Règim de modificació del conveni (en general, per acord unànime entre les parts).

• Termini de vigència: serà (excepte excepcions puntuals) de 5 anys prorrogables una vegada, abans de la seua finalització, per 5 anys més.

• Extinció i efectes de la resolució: entre altres, pel transcurs del termini de vigència; acord unànime de les parts; per decisió judicial o per incompliment de les obligacions assumides per les parts, i en aquest cas es podrà realitzar un requeriment, a través de la Comissió de Seguiment, a la part incomplidora perquè en un termini determinat procedisca a complir amb aquestes obligacions o, en cas contrari, assumir una possible indemnització.

• Liquidació del conveni: si comporten compromisos econòmics, hi haurà obligació de reintegrament o d'abonament, segons les circumstàncies. Si arribada la resolució del conveni, existeixen actuacions pendents d'execució, es podrà recordar la continuació de les mateixes perquè siguen executades establint un termini improrrogable. El compliment i resolució donarà lloc a la liquidació.

• En el cas de convenis signats amb les AAPP, perquè el conveni siga eficaç, l'obligació de publicació en el registre corresponent del document.

• Quan per l'activitat a realitzar es considere necessari, altres clàusules susceptibles de ser introduïdes són les relatives a la prevenció de riscos laborals i a la protecció de dades, o la normativa relativa a l'accés a la informació i transparència.

• En aquells convenis en els quals vaja a #desenvolupar un projecte en concret, és recomanable la inclusió d'un Annex, que servirà per a detallar aspectes com la descripció tècnica de les activitats d'I+D amb els seus objectius; metodologia; pla de treball i fites; lliurables i l'equip de treball. Pot #incloure també, si es considera oportú, el pressupost associat, que constituirà la memòria econòmica i podria estar lligat a les activitats o lliurables.